奥赛理论培训2012.pptx

2012生物学奥林匹克竞赛理论集训辅导氨基酸蛋白质和肽的组成单位通过共价键（肽键）相连蛋白质氨基酸和非蛋白质氨基酸 20种常见的蛋白质氨基酸+2种不常见的蛋白质氨基酸 相同的结构通式差别在侧链基团（R基团）所有的生物体都含有20种常见的蛋白质氨基酸2种不常见的蛋白质氨基酸：含硒半胱氨酸（第21种）和吡咯赖氨酸（第22种）蛋白质的不同结构与功能与氨基酸序列有关氨基酸的结构通式不同的侧链基团不同的理化性质氨基酸的分类脂肪族芳香族含硫族极性/不带电荷碱性/酸性疏水：非极性R基团 亲水：极性的R基团（电中性、带负电荷、带正电荷）必需氨基酸VS非必需氨基酸必需氨基酸是指人体必不可少，而机体内又不能合成、必须从食物中补充的氨基酸。如果饮食中经常缺少它们，就会影响健康。余下的氨基酸则属于非必需氨基酸，动物体自身可以进行有效的合成笨（苯丙氨酸）蛋（蛋氨酸）精（精氨酸）来（赖氨酸）宿（苏氨酸）舍（色氨酸）住（组氨酸）亮（亮氨酸）凉（异亮氨酸）鞋（缬氨酸） 氨基酸的性质缩合手性（Gly除外）酸碱解离性质与两性离子（pI及其计算）R基团的结构变化和化学反应性质氨基酸的缩合反应与肽D型氨基酸与L型氨基酸22种蛋白质氨基酸分子中，除了甘氨酸，均至少含有一个不对称碳原子，因此除甘氨酸以外的21种标准氨基酸都具有手性性质。如果以L型甘油醛为参照物，具有不对称碳原子的氨基酸就有D型和L型两种对映异构体。实验证明，蛋白质分子中的不对称氨基酸都是L型。D型氨基酸仅存在于一些特殊的抗菌肽和某些细菌的细胞壁成分之中，它们不能参入到在核糖体上合成的多肽或蛋白质分子之中。氨基酸的D型和L型与氨基酸的旋光方向没有必然的联系。所有氨基酸及具有游离α-氨基的肽与茚三酮反应都产生蓝紫色物质，只有脯氨酸和羟脯氨酸与茚三酮反应产生黄色物质。蛋白质分类结构伸展，呈纤维状，长/宽10，不溶于水或稀盐溶液，机械强度高，在生物体充当结构的角色，如胶原蛋白和角蛋白球状蛋白质结构紧密，呈球状，长/宽≤3～4，溶于水，如血红蛋白和胰蛋白酶等膜蛋白则定位于各种生物膜上，其结构有限，到目前为止，只有全α-螺旋或全β-折叠结构，一般由多个结构域组成，但至少有一个结构域是脂溶性的，如细菌视紫红质蛋白质的结构层次一级结构 (1o) : 独特的氨基酸序列，由遗传物质决定。二级结构 (2o) :多肽链的主链骨架本身（不包括R基团）在空间上有规律的折叠和盘绕，它是由氨基酸残基非侧链基团之间的氢键决定的。三级结构 (3o) :是指多肽链在二级结构的基础上，进一步盘绕、卷曲和折叠，形成主要通过氨基酸侧链以次级键以及二硫键维系的完整的三维结构。四级结构 (4o)具有两条和两条以上多肽链的寡聚蛋白质或多聚蛋白质才会有四级结构。其内容包括亚基的种类、数目、空间排布以及亚基之间的相互作用。蛋白质的四种结构层次蛋白质的一级结构是蛋白质的共价（肽键）结构对于每一种蛋白质而言，都是独特的。由编码它的基因的核苷酸序列决定。是遗传信息的一种形式。书写总是从N端到C端。 一种蛋白质的一级结构由编码它的基因的核苷酸序列决定DNA: GGC ATT GTG GAA CAA TGC TGT ACCmRNA: GGC AUU GUG GAA CAA UGC UGU ACC蛋白质: Gly- Ile- Val- Glu - Gln- Cys- Cys - Thr常见的二级结构-都由氢键稳定α-螺旋和其他螺旋β-折叠β-转角β-凸起无规则卷曲蛋白质的三级结构三级结构是指多肽链在二级结构的基础上，进一步盘绕、卷曲和折叠，形成主要通过氨基酸侧链以次级键以及二硫键维系的完整的三维结构。三级结构通常由模体（motif）和结构域（domain）组成。稳定三级结构主要是次级键，其包括氢键、疏水键、离子键、范德华力和金属配位键。此外，属于共价键的二硫键也参与许多蛋白质三维结构的形成。蛋白质构象一种蛋白质的全部三维结构一般被称为它的构象。注意不要将构象与构型混为一谈。构型是指在立体异构中，一组特定的原子或基团在空间上的几何布局。两种不同构型的转变总是伴随着共价键的断裂和重新形成；一个蛋白质可以存在几种不同的构象，但构象的转变仅仅是单键的自由旋转造成的，没有共价键的断裂和形成。 由于构成蛋白质的多肽链上存在多个单键，至少在理论上让人觉得一种蛋白质会可能具有许多不同的构象。然而，在生理条件下，一种蛋白质只会采取一种或几种在能量上有利的构象。维系三级结构稳定的化学键模体在结构生物学上，模体这个概念有两种不同的用法。第一种被用在一级结构上，特指具有特殊生化功能的特定氨基酸序列，因此被称为序列模体。例如，很多DNA结合蛋白的一级结构含有一段CXX(XX)CXXXXXXXXXXXXHXXXH序列（X代表任何一种氨基酸残基），它是形成锌指结构的特征序