第1章核酸结构与功能.ppt

一、元素组成 主要组成元素：C、H、O、N、P P平均含量：9%~10% 二、化学组成与基本单位 * 目录 * 目录 * 目录 * 目录 * 目录 * 目录 * 目录 * 目录 * 目录 * 目录 核酸 (DNA和RNA) 核苷酸(基本组成单位） 核苷和脱氧核苷 磷酸 戊糖 碱基 嘌呤 嘧啶 核糖 脱氧核糖 核酸组成 构成RNA 构成 DNA 戊糖 (ribose) (deoxyribose) 一、DNA的一级结构 DNA的一级结构 由dAMP、dGMP、dCMP、dTMP四种脱氧核苷酸通过3’，5’-磷酸二酯键按一定顺序排列而成的高分子化合物。 即：DNA分子中脱氧核苷酸残基的排列顺序（简称碱基序列。 5′-末端 3′-末端 C G A 磷酸二酯键 磷酸二酯键 A G P 5? P T P G P C P T P OH 3? 核酸分子结构表示方法： 5? pApCpTpGpCpT-OH 3? 5? A C T G C T 3? 两条多聚核苷酸链在空间的走向呈反向平行(anti-parallel)。两条链围绕着同一个螺旋轴形成右手螺旋(right-handed)的结构。双螺旋结构的直径为2.37nm，螺距为3.54nm。 脱氧核糖和磷酸基团组成的亲水性骨架位于双螺旋结构的外侧，疏水的碱基位于内侧。 双螺旋结构的表面形成了一个大沟(major groove)和一个小沟(minor groove)。 DNA双螺旋结构模型主要内容 1.DNA是反向平行、右手螺旋的双链结构 碱基互补配对: 鸟嘌呤/胞嘧啶 碱基互补配对: 腺嘌呤/胸腺嘧啶 相邻两个碱基对会有重叠，产生了疏水性的碱基堆积力(base stacking interaction)。 碱基堆积力和互补碱基对的氢键共同维系着DNA结构的稳定。 3.疏水作用力和氢键共同维系着DNA双螺旋结构的稳定。 三、DNA的三级结构与功能 超螺旋结构(superhelix 或supercoil) DNA双螺旋链再盘绕即形成超螺旋结构。 正超螺旋(positive supercoil) 盘绕方向与DNA双螺旋方同相同。 负超螺旋(negative supercoil) 盘绕方向与DNA双螺旋方向相反。 （一）DNA超螺旋 （二）染色质和核小体 真核生物DNA以非常有序的形式存在于细胞核内。 在细胞周期的大部分时间里，DNA以松散的染色质(chromatin)形式存在，在细胞分裂期，则形成高度致密的染色体(chromosome)。 四、DNA的变性、复性与分子杂交 核酸的酸碱及溶解度性质 核酸为多元酸，具有较强的酸性。 核酸的高分子性质 粘度：DNARNA dsDNA ssDNA 沉降行为:不同构象的核酸分子的沉降的速率有很大差异，这是超速离心法提取和纯化核酸的理论基础。 核酸的紫外吸收性质：A260 （一）DNA变性（denaturation) 在某些理化因素作用下，DNA双链解开成两条单链的过程。 定义 DNA变性的本质是双链间氢键的断裂。 增色效应(hyperchromic effect)：DNA变性时其溶液OD260增高的现象。 DNA解链时的紫外吸收变化 （二）DNA的复性（renaturation） 当变性条件缓慢地除去后，两条解离的互补链可重新配对，恢复原来的双螺旋结构，这一现象称为DNA复性(renaturation) 。 减色效应：DNA复性时，其溶液OD260降低。 热变性的DNA经缓慢冷却后即可复性，这一过程称为退火(annealing) 。 （三）分子杂交（hybridization） 不同种类的DNA单链分子或RNA分子放在同一溶液中，只要两种单链分子之间存在着一定程度的碱基配对关系，在适宜的条件可以在不同的分子间形成杂化双链(heteroduplex)。 这种杂化双链可以在不同的DNA与DNA之间形成，也可以在DNA和RNA分子间或者RNA与RNA分子间形成。这种现象称为核酸分子杂交。 研究DNA分子中某一种基因的位置。 监定两种核酸分子间的序列相似性。 检测某些专一序列在待检样品中存在与否。 核酸分子杂交的应用 RNA的种类、分布、功能 帽子结构:m7GpppNm 大部分真核细胞mRNA的5‘末端都以7-甲 基鸟嘌呤-三磷酸核苷为起始结构，3‘末端 有多聚腺苷酸结构。 mRNA核内向胞质的转位 mRNA的稳定性维系 翻译起始的调控 帽子结构和多聚A尾的功能 tRNA具有局部的茎环(stem-loop)结构或发卡(hairpin)结构。 2、tRNA具有茎环结构 tRNA的二级结构 ——三叶草形 氨基酸臂 DHU环 反