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研究报告
不同标度化方法对川楝子毒性的代谢组学研究
的影响*
Effects of different scale methods to the study of toxicity
metabonomics of toosendanin
王小娟1,2 2 1
刘妍如 肖炳坤
1 2
杨建云 赵安东
2 1**
杨 雁 黄荣清
1,2 2
Wang Xiaojuan Liu Yanru 摘 要 为探讨适合基于NMR 的代谢组学研究的数据预处理方法,利用3 种不同标
1 1 1
Xiao Binkun Yang Jianyun 度化方法对经川楝子染毒的大鼠尿液 H-NMR 积分值进行处理,然后进行主成分分
2 2
Zhao Andong Yang Yan 析。通过分析比较,发现中值标度化法最适于代谢组学的研究。
Huang Rongqing1 关键词 代谢组学 数据预处理 标度化 核磁共振
(1.安徽医科大学药理学教研室 合 Abstract To explore proper data processing method for NMR-based metabonomics, urine
肥 230032;2.军事医学科学院放射
samples from toosendanin dosed rats and control rats were detected using 1H-NMR and
与辐射医学研究所 北京 100850)
three different scales methods were applied to the spectrum integrations. Centering (Ctr) is
(1.Department of Pharmacology, Anhui
the best suitable method for NMR-based metabonomics through comparison and analysis.
Medical University, Hefei 230032;
Key words Metabonomics Data pretreatment Scales method NMR
2.Institute of Radiation Medicine,
Academy of Military Medical Sciences,
Beijing 100850)
代谢组学是继基因组学、转录组学和蛋白质组学后发 谢组学研究的目的就是研究其所有代谢物,而不同的样本
展的一门新兴组学,关注的是机体在内外源因素作用下体 中不同的代谢物存在较大浓度上的差异,如果不消除这种
内所有小分子代谢物的动态变化 [1]。通过观察这些小分 差异就会造成对机体变化贡献大的代谢组分被忽略,因而
子代谢物的变化可以得到机体的病理、生理信息。代谢组 为确保整个代谢组学研究结果的真实性,合适的数据处理
学研究中常用的分析技术有核磁共振(NMR )和液质联 起着决定性的作用。
用(HPLC/MS ),NMR 技术以其诸多优点而广泛应用于 一般基于 NMR 的代谢
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