中国栽培大豆群体结构不同分类方法的比较.pdfVIP

摇 南京农业大学学报摇 2011,34(2):13-17 摇 Journal of NanjingAgricultural University http:/ / 試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試 魏世平,刘晓芬,杨胜先,等.中国栽培大豆群体结构不同分类方法的比较[J].南京农业大学学报,2011,34(2):13-17 中国栽培大豆群体结构不同分类方法的比较 魏世平,刘晓芬,杨胜先,吕海燕,牛远,章元明* (南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室/ 国家大豆改良中心,江苏 南京210095) 摘要:利用215个大豆品种的135个分子标记数据,用 STRUCTURE软件、PowerMarker 软件和地理生态类型3种分类方法 研究了大豆品种的群体遗传结构,以探索适宜的分类方法。 结果表明:用STRUCTURE软件分类时,亚群间成对分化系数 (F )的平均值最大,为0.1083,含有相同最高频率等位基因的位点数最小,为85,说明各亚群间遗传差异最大;亚群内遗 st 传多样度(H )为0.491,多态性信息含量(PIC)为0.737 6,群体内分化系数(F )为0.974,均为最小,说明亚群内个体间遗 s is 传相似性最高。 因此,用STRUCTURE软件研究群体遗传结构最适宜。 关键词:群体结构;遗传多样性;STRUCTURE软件;聚类分析;大豆 中图分类号:S529摇 摇 摇 摇 文献标志码:A摇 摇 摇 摇 文章编号:1000-2030(2011)02-0013-05 Comparison of various clustering methods for population structure in Chinese cultivated soybean(Glycine max(L. )Merr. ) WEI Shi鄄ping,LIU Xiao鄄fen,YANG Sheng鄄xian,L譈 Hai鄄yan,NIU Yuan,ZHANG Yuan鄄ming* (State Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement/ National Center for Soybean Improvement,Nanjing Agricultural University,Nanjing210095,China) Abstract:Using geographic eco鄄type approach,STRUCTUREandPowerMarker softwares,molecular marker informationof 135markers in215 soybeancultivarsrandomly selectedfromChinawasusedtoinvestigategeneticstructureoftheabovepopulation,anditspurpose istofind a suitable cluster approach.Results showedthat STRUCTURE software results in a maximumpair鄄wiseF value of 0.1083 st among subpopulations and a minimum estimate of 85 for the number of loci with highest allelic frequency acro