小麦转录因子基因W16 的功能标记作图和关联分析.docVIP

中国农业科学  2012,45(9):1667-1675 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2012.09.001  小麦转录因子基因 W16 的功能标记作图和关联分析  雷梦林  1,2  2 2 2 2 1  2  （1 山西大学生物工程学院，太原 030006；2 中国农业科学院作物科学研究所/农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程，北京 100081） 摘要：【目的】开发小麦 DREB 转录因子基因 W16 的功能标记，进行遗传作图，并结合表型性状关联分析，为 利用分子标记进行小麦遗传改良提供依据。【方法】以六倍体普通小麦及其野生近缘种的二倍体和四倍体为材料， 克隆 W16 的 DNA 序列；根据序列多态性设计分子标记；利用中国春缺四体材料对基因进行染色体定位，用 DH 群体 （旱选 10 号×鲁麦 14）进行精细定位并作图；以 154 份六倍体普通小麦材料构成的自然群体分析表型性状与基 因单倍型的关联特性。 结果】利用中国春缺四体材料先将 W16 定位在 1A 染色体上。后利用 DH 群体将 W16 定位于 染色体 1A 的 CWM517 和 WMC20 标记之间，距左、右标记的遗传距离分别为 7.8 cM 和 19.4 cM。在小麦自然群体中 共检测到 W16 的 3 种单倍型，分别与单株穗数、穗粒数、每穗小穗数和籽粒饱满度关联。【结论】确定了 W16 所在 的染色体位置，鉴定出 Hap为增加单株穗数和籽粒饱满度的优良单倍型，Hap为提高穗粒数的优良单倍型，该 基因的功能标记和关联分析结果为小麦分子育种提供了重要信息。 关键词：普通小麦；W16；功能标记；遗传作图；关联分析 Functional Marker Mapping and Association Analysis of Gene W16 in Common Wheat LEI Meng-lin1,2, LI Ang2, CHANG Xiao-ping2, XU Zhao-shi2, MA You-zhi2, LIU Hui-min1, JING Rui-lian2 (1College of Bioengineering, Shanxi University, Taiyuan 030006; 2 Institute of Crop Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences/National Key Facility for Crop Gene Resources and Genetic Improvement, Beijing 100081) Abstract: 【Objective】 The objective of this study is to develop and map functional markers for W16, a gene of transcription factor DREB (dehydration responsive element binding) family, to analyze the relationship between haplotypes and phenotypic traits, and provide a basis for the genetic improvement by molecular markers in wheat (Triticum aestivum L.). 【Method】 The W16 was cloned from hexaploid wheat, and its diploid and tetraploid wild relative species. Molecular markers were developed according to sequence polymorphisms. Chromosomal location and genetic mapping of W16 were performed by Chinese Spring nulli-tetrasomic lines and a doubled haploid (DH) population (Hanxuan 10 × Lumai 14). The relevance between W16 haplotypes and phenotypic traits w