DGGE、RFLP分析脱色活性黑5混合菌群FF群落结构.docVIP

DGGE、RFLP分析脱色活性黑5混合菌群FF群落结构 范凤霞，谢学辉(，袁学武，朱文祥，刘娜，柳建设* (东华大学 环境科学与工程学院，上海，201620) 摘 要：通过DGGE对确定混合菌群FF微生物群落结构信息 关 键 词： 中图分类号：X 文献标识码：A composition of decolorization of Reactive Blank 5 microbe consortium FF by DGGE and RFLP Techniques FAN Fengxia, XIE Xuehui*, YUAN Xuewu, ZHU Wenxiang, LIU Na, LIU Jianshe* (College of Environmental Science and Engineering, Donghua University, Shanghai 201620, China) Abstract: [Objective] The purpose was to study the composition of decoloration of Reactive Black 5 microbe consortium FF. [Methods] Through denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE), restriction fragment length polymorphism (RFLP) technologies to analysis the composition of microbial communities of flora FF. [Results] DGGE results showed that the microbial species in flora FF were relatively simple, the growth dominant groups in the flora FF were Gamma-proteobacteria Proteus bacteria and Clostridia Clostridium bacteria; RFLP results showed that the flora FF had five kinds of bacteria, consisted of Gamma-proteobacteria Proteus bacteria 52.11%, and Clostridia Clostridium bacteria 45.07%. [Conclusion] DGGE and RFLP these two methods could be effective response to the flora FF’s microbial diversity condition. The combination of these two methods could initially identify the composition of microbial communities of flora FF. Key words：microbial consortium; DGGE; RFLP; composition of microbial communities 0 引 言 微生物是生物法处理偶氮染料废水的作用主体，通过微生物新陈代谢作用产生的酶，不断降解和矿化染料，在废水处理系统中起重要作用。然而，微生物种群结构和多样性的变化，会增加生物处理的难度。因此，以分子生物学技术为基础，研究废水处理系统中微生物群落组成、结构与功能、代谢活性等，了解微生物种群活动及其相互关系，以及微生物群落结构与废水生物处理效率的关联性，用于指导生物处理的理性设计和过程调控是废水微生物处理技术的重要研究方向，并且对提高微生物降解有机有毒污染物能力、提高偶氮染料废水处理效率具有重大意义。 目前，用于微生物生态研究的分子技术有DGGE、RADP、RFLP、TGGE、FISH、克隆文库、基因芯片等[]。其中RFLP和DGGE在各种微生物生态系统研究中应用的最广泛。聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术是直接利用微生物的遗传特性(DNA及RNA)进行表征的，因此研究者能够动态的评价微生物种群动态性和复杂微生物群落结构演替规律[]。目前，PCR-DGGE技术被认为是检测微生物群落结构最为有效的手段之一[]，并且该技术有非常明显的优越性在研究自然界微生物群落结构等方面，而对16S rDNA PCR产物进行RFLP分析，亦是获得细菌基因型信息的有效手段[]，RFLP非常适合用于种内和分类很接近的种间水