土壤宏蛋白质组学蛋白质提取方法及其应用.pdfVIP

2012-08-25 DOI: 10.3724/SP.J.1145.2012.00691 / Chin J Appl Environ Biol 2012 18 ( 4 ) : 691~696 应用与环境生物学报 ， * 土壤宏蛋白质组学蛋白质提取方法及其应用 王小丽 GONZALEZ PEREZ Pablo 叶 俊 黄丹枫** （上海交通大学农业与生物学院 上海 200240） 摘 要 土壤宏蛋白质组学在揭示土壤微生物功能、代谢与环境相互作用方面具有广阔的应用前景，但由于土壤样品 的特殊性，土壤蛋白质提取步骤是限制土壤宏蛋白质组学大规模应用的瓶颈之一. 本文从样品制备、提取方法、影响 因素等方面综述了土壤蛋白提取方面的研究进展. 一般来说，根据实验目的、蛋白种类及后续研究方法设计相应的分 组成收集策略才能取得较好的提取效果 . 土壤总蛋白、胞内蛋白与胞外蛋白分别有不同的提取方法. 总蛋白提取一般 采用直接提取法；胞外蛋白不需要裂解；胞内蛋白提取方法有直接提取法和间接提取法等. 裂解、浓缩、去除腐殖质 的方法以及提取液、pH值的选择等也会影响提取效果. 此外，简单介绍了土壤宏蛋白质组学的应用，并对今后的研究 工作提出展望. 表 1 参36 关键词 土壤微生物；宏蛋白质组学；蛋白质提取方法；应用 CLC S154.3 Methods of Protein Extraction from Soil and Their Potential Application in Study of Soil Metaproteome* WANG Xiaoli, GONZALEZ PEREZ Pablo, YE Jun HUANG Danfeng** (School of Agriculture and Biology, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai 200240, China) Abstract Metaproteomics has a bright future for its broad application in understanding the interaction between environment and function, metabolism of the soil microbial community. Due to the specialty of soil sample, the extraction method is one of the main bottlenecks which limit their wide application. This paper summarized research actuality of soil protein extraction on several aspects from sample preparation, extraction methods and influencing factors, pointed out some currently-existing research problems, and put forward new extraction method and thought exploiture from traditional methods. In general, only by proceeding from the experimental purpose, protein types and follow-up stu