生物信息学研究进展.pdfVIP

第 27 卷第 1 期 家畜生态学报 Vol . 27 No . 1 2006 年 1 月 Act a Ecolo giae A nimali s Do ma stici J an 2006 生物信息学研究进展 孙 　敏1 ,2 , 马月辉1 , 叶绍辉2 ( 1. 中国农业科学院畜牧研究所 ,北京 　100094 ; 2 . 云南农业大学动物科学技术学院 ,云南 昆明　65020 1) [摘 　要] 　随着计算机科学和生物科学的迅猛发展 , 由此而诞生的生物信息学逐渐发展成为 一门独立的学科 。它将会成为 2 1 世纪生命科学中的重要研究领域之一 。本文简单介绍了生 物信息学的产生 ,发展 ,研究内容 ,应用及未来的发展方向等 。 [ 关键词] 　生物信息学 ;基因组学 ; 蛋白质组学 ;算法问题 ;数据预测分析模型 [ 中图分类号] 　S811. 5 [文献标识码] 　A [文章编号] (2006) 0 1000605 ( ) 　　生物信息学 Bioinfor matics 是由生物科学 ,计 发展成为一门独立的学科 。 算机科学 ,信息科学 ,应用数学 ,统计学等多门学科 1. 2 　生物信息学的发展 相互交叉而形成的一门新兴学科 。它以计算机为主 生物信息学是伴随着人类基因组计划的实施逐 要工具 ,开发各种软件 ,对 日益增长的 DN A 和蛋白 渐发展壮大起来的 ,其发展历程大致经历了三个阶 质的序列和结构等相关信息进行收集 、储存 、发行 、 段[3 ] ,前基因组时代 :这一阶段生物信息学的主要工 提取 、加工 、分析和研究 , 同时建立理论模型 ,指导实 作包括生物数据库的建立 , 检索工具的开发 以及 验研究 ,它由数据库 、计算机网络和应用软件三大部 DN A 和蛋白质序列分析 。基因组时代 :这一阶段生 分构成[ 1 ] 。它包含了两个方面 :一是对海量数据的 物信息学的主要工作是大量核苷酸序列测定 、分析 、 收集 ,整理与服务 ; 另一方面是从中发现新的规律 。 新基因寻找和识别 , 以因特网为基础的网络数据库 生物信息学不只是一门为了建立 、更新生物数据库 系统的建立和交互界面的开发以及基因组序列信息 及获取生物数据而联合使用多项计算机科学技术的 的提取分析等 。后基因组时代 :这一阶段生物信息 应用性学科 ,也不仅仅是只限于生物信息学这一概 学的主要研究工作将包括蛋白质组学研究及人类基 念的理论性学科 。事实上 ,它是一门理论概念与实 因组注释 。 践应用并重的学科 。它不仅具有重要的学术价值 , 现在世界上已有 4 个比较权威的生物信息学中 ( 还有很大的商业价值 ,有着远大的发展前景 。随着 心 。他们分别是 :美国国家生物技术信息中心 N C ) ( ) 后基因组时代的到来 ,它将发挥着越来越不可替代 B I 、基因组序列数据库中心 GSDB 、欧洲生物信 的作用 。可以毫不夸张地说 ,