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第21卷第4期 激光生物学报 V01.2lNo.4
2012年8月 ACTALASERBIOLOGYSINICA Aug.2012
doi:10.3969/j.issn.1007-7146.2012.04.011
拟南芥GHMP基因家族成员的组织表达及
生物信息学分析
袁聪颖8,常洪平8,叶佳卓“,王育3,胡帅8,胡怀斌8,李秀山8,郭新红”
(湖南大学 a.生物学院,化学生物传感与计量学国家重点实验室;b.电气与信息工程学院,湖南长沙410082)
摘 要:利用生物信息学方法获得拟南芥全基因组中12个GHMP基因家族成员。通过实时定量PCR技术研
究这12个基因在不同组织中的表达,结果显示它们具有组织表达特异性。构建了拟南芥中GHMP基因家族成
员的系统进化树。启动子区调控元件分析表明,大多数GHMP成员包含有光响应、生物钟及其它逆境胁迫响应
的相关元件,预测这些GHMP基因家族成员可能参与了植物的光信号、生物钟及相关的逆境胁迫信号转导
途径。
关键词:拟南芥;GHMP基因家族成员;组织表达;生物信息学分析
中图分类号:Q786
文献标识码:A
文章编号:1007-7146(2012)04-0346-06
Tissue andBioinformaticofGHMP
Expressions Analysis
Gene Membersin
Family Arabidopsis
YUAN Jiazhu06,WANGYu8,HUShuai。,
Congying。,CHANGHongping“,YE
HU
Huaibin8,LIXiushan。,GUOXinhong。+
a.State of and of
(Hunan Chemo/BiosensingChemometrics,SchoolBiology;
University KeyLaboratory
Information
ofElectricaland Engineering,Changsha410082,Hunan,China)
b.College
12GHMP memberswereidentifiedinthe bioinformaticmethods.
Abstract:The family Arabidopsisgenomeusing
gene
The real·timeRT—PCRwasusedtodeterminetheirtissue resultsshowedthetissue
patterns.The
quantitative expression
ofGHMP treewasconstructedthe
specificitypattern geneexpressions.Thephylogenetic by neighborjoining(NJ)meth—
of12 some
odbasedonth
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