基于16S rDNA的肠道微生态分子流行病学实验室检测方法.pdfVIP

·综述· 基于16S rDNA的肠道微生态分子流行病学 实验室检测方法 周翔天胡立芬李家斌 【摘要】 由于肠道菌群的复杂性，使得检测与分辨菌群具有极大的挑战性。传统的肠道菌群分析方 法因所需时间长、操作繁琐、敏感度低等局限，逐渐遭到淘汰。随着对核酸研究的深入及分子生物学技术的 发展，目前多采用基于16SrDNA基因序列的分子流行病学实验室检测方法用以分离和鉴定肠道微生物。 【关键词】肠杆菌科；16SrDNA；分子流行病学；PCR r11陀molecular detectionmethodsofintestinal basedon16SrDNAZHOU epidemiologicallaboratory microecology Xiang-tian，HU脚n，15Jia-bin．Oep矾mentofhfectioasDiseases，如First MedicalUni一 AffiliatedHospitalofAnhui 23∞22．China 娜如v，He[el Corresponding author：15胁一bin，E-mail：lifiabin948@rip．sohu．com Becauseofthe ofintestinal isa todetectand differentflo— 【Abstract】 complexity flora，itgreat challenge identify ras．Thetraditional islimitedfor method，which longrequlredtime，complicatedoperation，lowandSOon，is sensitivity nowwashedout．Withthe onnucleicacidsandthe ofmolecular deepeningstudy development biologicaltechnique，there isacommonuseofseveral methods molecular detection basedon16SrDNA for epidemiologicallaboratory genesequence microbial andidentification． separation 【Keywords】Enterobacteriaceae；16SrDNA；Molecular epidemiology；PcR 16S 人的肠道中包括了十几个菌属中的4000～5000rDNA序列由10个可变区和11个保守区交替组 个菌种，有超过1014个细菌共同构成人类的肠道微成。保守区的DNA序列在细菌遗传过程中高度保 生态菌群LlJ。如何准确和完整的描述肠道微生物种 守，且在原核生物中不发生水平位移。研究者常通 群的多样性、数量比例和系统进化等对肠道菌群的 过16SrDNA的保守区域序列设计引物，再利用其高 研究尤为重要。 变区进行序列问的比对，反映不同生物间的进化关 临床上传统的病原微生物鉴定方法因细菌培养 系_3 J，适用于物种的鉴定和各类生物亲缘关系的研 的限制，一般需要3～4d左右，操作耗时且过程繁 究HJ。本文主要就基于16SrDNA肠道微生态的分 琐，极有可能延误对患者的诊疗，对临床研究