基于线粒体cox1片段序列胶州湾浮游动物物种组成分析.pdfVIP

第 42卷 第 5期 海 洋 与 湖 沼 VO1．42．NO．5 2011年 9 月 OCEANOLOGIA ET LIMNOLOGIA SINICA Sep．，2011 基于线粒体 coxl片段序列胶州湾浮游动物 物种组成分析木 王仁诚 ，2 王敏晓 程方平 ，2 李超伦 孙 松 ，① (1．中国科学院海洋研究所海洋生态与环境科学重点实验室 青岛 266071；2．中国科学院研究生院 北京 100049； 3．山东胶州湾海洋生态系统国家野外科学观测研究站 青岛 266071) 提要 基于 cox1片段序列的DNA条形码为浮游动物种类鉴定提供 了新的可靠手段，构建 了胶州 湾网采浮游动物 DNA 条形码文库，在 国内首次使用宏遗传组学方法研究夏季胶州湾海洋浮游动物 的群落组成。共获得环境样 品DNA条形码 149条；以6％为阈值共检 出37个OUT，其 中19个与DNA 条形码数据库 中序列程度非常高(97％)，可 以鉴定到种。基于形态的镜检分析共观测到浮游动物31 种／类，低于基于DNA条形码的分析结果。全生活史阶段的浮游动物种类鉴定是DNA条形码相对于 传统形态分类的最大优势，基于DNA条形码的分析成功鉴定出日本蝽、太平洋牡蛎等无脊椎动物的 浮游幼体。研究结果表明，通过构建环境样 品的coxl序列文库，可以实现海区浮游动物物种丰度和 群落组成情况的快速评估。 关键词 浮游动物，coxl基因，DNA条形码，群落，环境 中图分类号 Q958 海洋浮游动物是指 自主游泳能力较弱，主要行 胶州湾位于黄海西岸，是一个暖温带半封闭的 随波漂流运动方式的海洋动物(郑重等，1984)。它们 海湾，沿岸一带工业 、农业、养殖 、港 口发达，受 自 虽然个体普遍较小，但是数量众多，是海洋生态系统 然环境和人类活动的双重影响。该海湾已被作为研究 中次级生产力的主要贡献者。浮游动物承上启下，处 人类活动以及气候变化对近海生态系统影响的模型， 于海洋生态系统物流 、能流通路 的中间环节，在海洋 开展了大量的工作(李开枝等，2007；王勇等，2002； 生态系统中起到重要的调控作用；同时，作为仔幼鱼 吴玉霖等，2004)。浮游动物的长期观测对于理解胶州 的重要饵料，浮游动物数量、结构的变化直接影响渔 湾生态系统的演替意义重大，但 已有胶州湾浮游动 业资源的产出(Harrisetal，2000)。浮游动物具有生活 物研究的报道多集 中在周年尺度 的观测 (孙松等， 史短，代谢活动强烈，随波逐流分布广泛等特点，因 2008；王倩等，2010)。由于浮游动物种类繁多、数量 此该类群对于海洋环境的扰动非常敏感。它们犹如放 巨大，如何准确、快速地进行种类鉴定和长期评估始 大器一般 ，其群落结构的演替可 以准确反馈海区乃 终是一个难题。浮游动物种类鉴定要求的专业技术性 至全球气候的细微变化(Haysetal，2005)。浮游动物 强，而且费时、费力，致使其数据结果严重滞后于其 作为重要指标，已经广泛应用于多个海区生态系统 它学科，无法满足现代海洋科学研究强调的多学科 环境长期变化的研究中(Planqueetal，1998；Beaug— 综合分析、快速检测、数据交换 比对等需求。 rand，2009；李强等，201O)。 线粒体编码的细胞色素氧化酶第一亚基 (cox1) 国家海洋局海洋公益性行业科研专项，200805042号；国家重点基础研究发展计划(973)项 目，2011CB403601号；国家 自然 科学基金项 目；中国科学院方向群项 目，KZCX2一YW-QO7—05号；中国科学院对外合作重点项 目，GJHZ200808号。王 仁诚 ，E—mail：wrc