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第 32 卷 第 6 期 广东海洋大学学报 Vol.32 No.6
2012 年 12 月 Journal of Guangdong Ocean University Dec. 2012
低渗诱导凡纳滨对虾肝胰腺消减文库的构建及其
表达序列标签分析
1, 2 1 1 1 1 1
郜卫华 ,迟淑艳 ,谭北平 ,刘泓宇 ,董晓慧 ,杨奇慧
(1. 广东海洋大学水产学院,广东 湛江 524025 ;2. 长江大学动物科学学院,湖北 荆州 434023 )
摘 要:初始体重(0.27±0.01)g 的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei )分别于盐度 2 和 30 中饲养 56 d,采用抑
制性消减杂交技术构建低渗胁迫诱导的凡纳滨对虾肝胰脏差异表达基因消减 cDNA 文库。消减杂交效率分析显示,
正反向消减文库差异表达的基因各富集大约 25 和 25~10 倍。从正反向两个文库中随机挑选 200 个阳性克隆进行测序(正
向文库 80 个,反向文库 120 个),共获得 179 条序列长度大于 100 bp 的 ESTs 序列,经 CAP3 在线拼接程序得到 73
条 Unigenes(19 条 contigs 和 54 条 singlets)。生物学信息分析表明,这些 Unigenes 所代表的相应基因的功能包括免
疫相关蛋白、代谢相关蛋白、核蛋白、细胞凋亡和转移蛋白。这些基因信息表明,凡纳滨对虾在低盐胁迫诱导所导
致的生理变化非常复杂,构建的差异表达 cDNA 文库可较好地反映低盐胁迫对凡纳滨对虾影响的基因信息。
关键词:凡纳滨对虾;肝胰脏;低渗胁迫;抑制性消减杂交(SSH );表达序列标签(EST )
中图分类号:Q75 ;Q959.223+ .63 文献标志码:A 文章编号:1673-9159 (2012 )06-0001-09
Construction of the Hepatopancreas Subtractive cDNA Library of
Litopenaeus vannamei Induced by Hyposmotic Stress and ESTs Analysis
GAO Wei-hua 1, 2 1 1 1 1 1
, CHI Shu-yan , TAN Bei-ping , LIU Hong-yu , DONG Xiao-hui , YANG Qi-hui
(1. Fisheries College, Guangdong Ocean University, Zhanjiang 524025, China;
2. School of Animal Science, Yangtze University, Jingzhou 434023, China)
Abstract: To investigate the effect of low salinity stress on gene expression of hepatopancreas in shrimp,
we applied suppression subtractive hybridization (SSH) in juvenile white shrimp (Litopenaeus vannamei)
exposed to low salinity. The shrimps (i
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