SRY基因的检测.ppt

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SRY基因的检测 原理 1聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)的基本原理是,通过热变性使目的DNA(模板DNA)双链解开;通过退火将引物复性结合到它们的互补位置;通过DNA聚合酶延长引物,反复循环体外扩增出大量一对引物之间的DNA片段。 聚 合 酶 链 反 应 Polymerase Chain Reaction(PCR) PCR基本工作原理 以拟扩增的DNA分子为模板,以一对分别与模板3’和5’端相互补的寡核苷酸片段为引物,在DNA聚合酶的作用下,按照半保留复制的机制延模板链延伸直至完成新的DNA合成。 重复这一过程,可使目的DNA片段得以扩增。 PCR体系基本组成成分 第一轮循环 第二轮循环 第三次循环 PCR的主要用途 原理 2 人类个体的表型性别是由Y染色体决定的,具体地说是由Y染色体上编码睾丸发育的睾丸决定因子(testis determining factor,TDF)基因所决定,TDF基因的存在决定着睾丸的发育,即决定个体发育为男性。研究表明TDF基因位于Y染色体短臂与拟常染色体相接的35kb区域,该区域又称为Y染色体性别决定区(sex determining region of the Y,SRY)。 。 3 在SRY基因区域设计特异的引物,如果能够利用PCR技术体外扩增出SRY基因片段,即可判断为男性,否则为女性。本实验在SRY基因区域内设计了一对引物,利用引物Y1.5/ Y1.6扩增出一239bp的片段。 4 利用PCR技术扩增SRY基因片段检测性别具有广泛的实际应用价值,如结合细胞遗传学的核型分析,通过确认SRY所在区域的缺失或易位,诊断46,XY女性或46,XX男性性反转综合征的患者;通过检测胎儿的性别,预防甲型血友病、G6PD缺乏症等X连锁隐性遗传病患儿的出生; 一、?由微量外周血标本制备模板DNA 试剂与材料: 1、 细胞裂解缓冲液 (SDS ;蛋白酶K )   2、酚:氯仿:异戊醇(25:24:1体积比)   3、3mol醋酸钠(PH5.2)   4、无水乙醇,-20℃保存   5、70%乙醇,-20℃保存 6、TE缓冲液 步骤 1、1.5ml Eppendorf离心管中加入细胞裂解液100μl。 2、取末梢血一滴(约5-10μl)立即悬浮细胞裂解液中,37℃保温2小时。 3、加入100μl酚:氯仿:异戊醇(25:24:1体积比)混合液,盖紧。轻轻摇混,充分混合;室温15000rpm离心5分钟。 4、用开口粗的吸管转移上层水相于新的Eppendorf离心管,按步骤5重复抽提1次。如果水相还混浊,增加一次酚抽提。 步骤 5、转移上层水相,加入10μl 3mol醋酸钠(PH5.2)轻摇混匀,再加入250μl冷无水乙醇沉淀DNA。室温放置10分钟。 6、4℃15000rpm离心15分钟,使DNA沉淀(颗粒化)。 7、弃上清,加70%冷乙醇500μl轻振混匀,4℃15000rpm离心5分钟。 8、弃上清,将Ep管倒置在纸巾上,完全除去水分。将DNA自然干燥。 9、加10μl TE溶解,制成DNA样品。(进行PCR时,取1μl即可)。 二、PCR检测性别 试剂与材料: 1、?? 上、下游引物 (各5 μmol/L) 2、?? 模板DNA溶液 3、?? 10×PCR缓冲液:(高压灭菌) 4、?? dNTPs溶液(2.5mmol/L原液) 5、?? Taq DNA聚合酶(5U/μl) 6、?? 液体石蜡(高压灭菌) 琼脂糖凝胶电泳分离DNA片段 7、电泳级琼脂糖 8、电泳缓冲液:5×TBE贮存液 9、5mg/ml的溴化乙锭溶液,4℃暗存。 10、上样缓冲液:0.25%溴酚蓝,0.25%二甲苯青,30%甘油于水中。4℃贮存。 11、微波炉、电泳仪、水平电泳槽、制胶模和加样孔梳齿。 12、透射紫外灯、照相机和胶带纸。 (二)、PCR反应 1、?? 在0.5ml Eppendorf管中依次加入 H2O 60.5μl 10×PCR缓冲液 10μl dNTPs溶液(2.5mmol/L原液) 8μl(0.2mmol/L) 上游引物 (5 μmol/L) 10μl (0.5μmol/L) 下游引物 (5 μmol/L) 10μl(0.5μmol/L) 模板DNA溶液(基因组DNA溶液) 1μl Taq DNA聚合酶(5U

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