中国近海与日本近海白姑鱼线粒体细胞色素b基因全序列比较分析.pdfVIP

第 17卷第6期 中国水产科学 Vo1．17 NO．6 2010年 11月 JournalofFishery SciencesofChina November 201O 中国近海与 日本近海 白姑鱼线粒体细胞色素 基因全序列比较分析 李昂 ，高天翔 1，孙典荣2 (1．中国海洋大学 海水养殖教育部重点实验室，山东 青岛266003；2．中国水产科学研究院 南海水产研究所， 广东 广州510300) 摘要：对中国近海和 日本近海共 l9尾 白姑鱼(Pennahiaargentata)线粒体细胞色素 b(Cytochromeb，Cyt6)基因全 序列进行扩增与测定，白姑鱼个体的Cytb基因总长度均为 1141bp。序列分析结果显示：Cytb基因全序列中共 检测到 4O处核苷酸替代，全部为同义替换，且主要来 自密码子第三位点。l9尾 白姑鱼个体共定义了 14种单倍 型。核苷酸组成分析表明：白姑鱼Cytb全序列的鸟嘌呤(G)含量较低，在第三密码子位点上表现得尤为明显。基 于邻接法、最大简约法、最大似然法和贝叶斯法构建的系统树结果基本一致，中国近海和日本近海的白姑鱼明 显分为2个单系群，两组群间的净遗传距离为0．019，基于Cytb2％／百万年分子钟计算，其分化时间约为95万年， 中、日近海 白姑鱼分化事件发生于晚更新世(LatePleistocene)。本研究旨在探讨中、 日近海 白姑鱼组群的分类地 位的遗传学依据，为白姑鱼渔业资源的管理与保护提供基础参考。[中国水产科学，2010，17(6)：l166—1172】 关键词：白姑鱼；细胞色素 b基因；遗传距离；分歧时间；中国近海；日本近海 中图分类号：Q959 文献标识码：A 文章编号：1005—8737一(2010)06—1166—07 白姑 鱼 (Pennahiaargentata)隶 属 于鲈形 目 度 内不受饱和效应的严重影响，被认为是解决种 (Pleuronectiformes)、石首鱼科(Sciaenidae)、白姑鱼 内和近缘种问亲缘关系以及遗传问题的理想工具， 属(Pennahia)，为暖温性近底层鱼类…，分布于 日本 已成为近年来鱼类分子进化研究中常用的标记之 【5l 一 本州岛东北部至中国广东海域 2【J。白姑鱼是中国重 一 要的经济鱼种之一，国内外学者 已从生态学、生物 有关 白姑鱼遗传学研究报道很少。蒙子宁等L9J 学特性等方面对其进行了一定程度的研究L3J。 利用 16SrRNA基因序列对 8种石首鱼类的系统 分子遗传学数据为海洋鱼类的群体遗传结构 发育关系进行了研究，并对 白姑鱼亚科下属间差 和进化关系提供了非常重要的证据L4J。鱼类线粒 异进行 了探讨：陈泉梅等 [10]通过对几种石首鱼 体 DNA分子结构简单、具有单一的母性遗传、几 16SrRNA 基因部分序列进行分析，探讨了白姑 乎不发生重组、进化速率快并且在其不同的区域 鱼属的分类地位；韩志强 11-121通过对 自姑鱼分 进化速度存在差异的特点，使其成为了重要的分 布区内不同群体的线粒体DNA控制区和Cytb基 子标记而被广泛应用于鱼类群体遗传学和系统发 因部分序列的分析，并结合 AFLP技术对 白姑鱼 育学研究 】。其中，细胞色素6(Cytochromeb，Cyt 的分子系统地理分布模式进行了研究。其研究结 6)是构成线粒体氧化磷酸化系统复合体Ⅲ的重要 果表明，中、日近海 白姑鱼组群问遗传分化显著。 成员之一，其进化速度适中6【】，在一定的进化尺