大鲵α1-血红蛋白基因的生物信息学分析及组织表达研究.pdfVIP

第 33卷 第 6期 家畜生态学报 VoI．33NO．6 2012年 11月 ActaEcologiaeAnimalisDomastici Nov．2012 ¨ … ) ‘ 5科学研究 i … 大鲵 1一血红蛋 白基因的生物信息学 分析及组织表达研究 杨 辉 ，艾 闽 ，李锋刚 ，刘小林 ，王立新 (1．西北农林科技大学 动物科技学院，陕西 杨凌 712100；2．陕西省农业分子生物学重点实验室，陕西 杨凌 712100) [摘 要] 从大鲵皮肤 cDNA文库中分离获得大鲵 d1一血红蛋 白基 因全长 cDNA序列，生物 信息学分析表明，大鲵 d一血红蛋白基 因全长cDNA序列为 594bp，开放阅读框共 432bp，编码 144个氨基酸，编码的大鲵 a1一血红蛋 白推测的理论分子量为 16．05kDa，等 电点为 6．44。氨 基酸组成 中酸性氨基酸 11．9 ，中性氨基酸 69．996／，碱性氨基酸18．2 。结构分析表明，该蛋 白没有信号肽 ，但在 1O0～l22个氨基酸处以及 98～122个氨基酸处分别有 由里向外、由外向 里的跨膜螺旋 区，二级结构以a一螺旋为主。氨基酸序进行 同源性列 比对表 明与人 、猕猴的亲 缘关系最近，和牛蛙的亲缘关系最低只有 35 。荧光定量PCR结果表明，a1一血红蛋白基因在 肌 肉中表达量最高，在 胃中最低。 [关键词] 大鲵；0c1一血红蛋 白；生物信息学分析 ；组织表达 [中图分类号] $811．6 [文献标识码] A [文章编号] 1005—5228(2012)06—0011-05 大鲵 (Andriasdavidianus)是 3亿年前与恐龙 一 定的抗菌活性。Hobson¨5]发现具有完整结构 的 同一时代生存并延续下来 的珍稀物种 ，也是现存最 血红蛋 白四聚体有抗 菌的作用 ；Fogaca]从牛蜱肠 大的两栖类动物 ，被称为 “活化石”，为我 国特有珍稀 内容物 中分离提纯化了一种抗菌肽 ，随后鉴定是牛 两栖动物 ，隶属两栖纲 ，有尾 目，隐鳃鲵科。由于大 血红蛋 白a链 的第 33～61位氨基酸片断。另有研 鲵处于水生脊椎动物 向陆生脊椎动物过渡的类群 ， 究指出，Schally等 7『]研究分离出的具有生长激素释 在研究动物进化和地理分布等方面有着重大的科学 放功能的十肽，最后经鉴定证明是血红蛋 白的 I3链 价值口]。同时，大鲵作为两栖动物 ，其皮肤分泌物 的一个片段 ；Takagic胡从牛脑 中发现了止痛肽段 ， 含有丰富的生物活性物质 ，是可供人类利用的生物 后来被证实是血红蛋 白的 a链的 C端片段。此外， 资源宝库 J。 血红蛋 白的肽段与人的肺腺癌、何杰金氏病 、阿茨海 血红蛋 白(hemoglobin，Hb)是一组红色含亚铁 默症 ¨g等临床疾病的发生均存在一定的关系 。 离子携氧蛋 白质 ，广泛存在豆科植物根瘤当中，也存 本文首次研究和报道 了大鲵 a1一Hb基 因，对其 在于脊椎动物 、少数无脊椎动物血液 中 ]。血红蛋 可能的结构进行了分析和预测 ，研究了其在大鲵各 白由四条链组成 ，两条 a链和两条 8链 ，每条链存在 个组织中的表达分布特征 ，为进一步研究该基 因在 一 个可以包含一个二价铁离子 的环状血红素，当血 大鲵免疫系统 的功能和作用奠定了基础。 红素与氧发生结合时 ，就形成了氧合血红蛋白，呈现 1 材料与方法 鲜红色并且其化学价保持不变 ，而与氧发生解离后 却呈现出淡蓝色 。血红蛋 白能够结合并且运输氧 ，