14.油菜EST资源的SSR信息分析.pdfVIP

2007年 3月 中国油料作物学报 2007 , 29 ( 1) : 20—25 Ch ine se jou rnal of o il crop science s 油菜 EST资源的 SSR 信息分析 李小白, 张明龙 , 崔海瑞 (浙江大学原子核农业科学研究所 ,浙江 杭州 3 10029) 摘要 :从 NCB I公共数据库获得 63 334 条油菜 EST,通过前处理得到全长为 12 165. 38kb 的无冗余 EST 17 987 条 。在这些序列中搜索出 2 803个 SSR ,分布于 2 443条 EST中 ,出现频率是 15. 58% 。这些 EST - SSR 的平均长度 为 18. 84bp ,平均分布频率是 1/4. 34kb。二核苷酸重复和三核苷酸重复是主要的类型 ,二者出现的频率基本相近 , 占总 SSR 的 89. 05% 。A G/CT和 AA G/CTT是二