粪便DNA分析技术在动物生态学中的应用.pdfVIP

动物学报 　47 (6) :699 ～703 , 2001 A cta Zoologica S inica 　　　　　 　 方法和观点 Methods and Viewpoints 粪便 D NA 分析技术在动物生态学中的应用 王戎疆 (北京大学生命科学学院 , 北京 100871) 摘 　要 　粪便 DNA 分析是一项新发展起来的从粪便中获取动物 DNA 并用于相关研究的技术 , 该技术有助于分 子生态学研究中所遇到的取样难题。通过对粪便 DNA 分析的研究方法、研究内容以及研究进展情况的介绍 , 提 供了该技术不仅能用于分子生态学的许多研究领域 , 而且还能够提供诸如种群数量估计、领域边界划定等生态 学信息 , 这是对分子生态学的重要补充。 关键词 　粪便 DNA 分析技术 　分子生态学 　非损伤性取样 　种群数量估计 　　近年来 , 随着分子生物学技术的日益发展 , 影响到野外采集数据的准确性。如果研究对象是濒 分子生物学研究也和越来越多的学科相结合 , 从而 危动物 , 对个体的伤害则有可能影响到整个种群 , 扩展了原有的研究范围。粪便 DNA 分析技术以动 甚至整个物种的安危。因此 , 人们尝试各种方法最 物粪便为实验材料 , 应用分子生物学手段研究动物 大可能地减少对动物的干扰及伤害 , 即非损伤性取 的DNA , 从而获得动物有关的遗传信息 , 这是一 样 (noninvasive sampling) , 例如采集动物的毛发 项新发展起来的分子生态学技术。该技术还能提供 作为实验材料 ( Taberlet et al . , 1992) 。 诸如瞬时种群数量估计、领域边界划定等有价值的 动物体时时刻刻都在进行着新陈代谢 , 生成许 生态学资料。这就使得分子生态学现有的研究范围 多新细胞来替代老细胞 , 这些被替代的细胞或是被 得以扩展。粪便 DNA 分析技术已成为生态学的一 分解 , 或是脱落 , 最终被重新吸收或排出体外。在 个研究热点 (李明等 , 2001) 。 粪便经过肠道的过程中 , 肠道会有一些脱落细胞混 在其中 , 一同排出体外。研究表明 , 每克人新鲜粪 1 　粪便 DNA 分析技术的建立 5 便中会含有 10 个肠道细胞 , 而且大部分是活细胞 分子生物学在生态学研究中的广泛应用 , 使得 (Albaugh et al . , 1992) , 这就意味着我们可以从 原来的种群、群落和生态系统的宏观生态学深入到 粪便中获取粪便产生者的 DNA , 进行遗传分析。 生物的遗传结构及基因多样性等微观领域 , 即分子 在野外搜集粪便的难度远比捕获动物或是收集毛发 生态学 (molecular ecology) 。在动物分子生态学研 要小很多 , 而且无需见到生活个体。这样就几乎完 究中 , 获取实验材料一直是困扰着研究者的一大难 全不干扰野生动物的正常活动 , 基本解决了分子生 题。比较常用的方法是捕获或麻醉动物 , 然后采集 态学研究中所遇到的取样难题。Hss 等 ( 1992) 血液或组织。但是 , 这一方法存在诸多问题 , 使其 发表了第一篇关于从熊的粪便中获得 DNA 的文 应用受到极大的限制。首先 , 由于野生动物对人类 章 , 这标志着粪便 DNA 分析技术的