家蚕基因组P450基因家族的分析.pdfVIP

20l0年 1O月 皖 西 学 院 学 报 Oct．，2010 第 26卷第 5期 JournalofWestAnhuiUniversity Vo1．26 N0．5 家蚕基因组P450基因家族的分析 周 权 ，王宝玉 (1．安徽农业大学 研究生学院，安徽 合肥 230036；2．阜阳师范学院 附属 中学，安徽 阜阳236041) 摘 要 ：利用家蚕基 因组 mRNA和氨基酸教据库 对P450基 因进行搜 索．结果显示：在 家蚕基 因组 中发现 77个 P450基 因． 分别归于 l8个 P450家族和26个亚家族，其 中有 9个多基 因家族 。3个基 因家族的成员超过 lO个，CYP4有 20个成员。是一个 典型的多基 因家族 。对 P450基 因进行正选择、基 因转换和基序分析。结果表 明：1个组(包含 3个 P450s基 因)中检测 出了显著 的正选择替换位点，在这 1个组 中．转换事件的次数为 3次。 关键词 ：家蚕 ；细胞 色素 P450；正选择 ；基 因转换 中图分类号 ：Q969．9 文献标识码 ：A 文章编号 ：1009—9735(2010)05—0074—03 细胞色素P450加单氧酶(eytochromeP45O。mono-- 因组中P450首先用 P450的 HMM(HiddenMarkov oxygenases，P45Os)是一类由超基因家族编码的含血红 mode1)序列 在本 地家蚕 mRNA 数据库 中进行 素和巯基的结合蛋白[1]。P450的重要特征是还原型细 TbIastN(Evaluethreshold 0．01)搜索，得到所有 胞色素P450与 CO结合形成的复合物，在波长 45Onot 可能是 P450类型基因的序列；再到相应的氨基酸数 处有最大的特征性吸收峰(峰)，细胞色素P45O命名正 据库寻找相对应的氨基酸序列，然后将这些基因序列 是由来于此。P45O的系统命名是根据氨基酸序列的相 对应的氨基酸序列分别通过 Pfam程序检验其是否 似程度作为划分 P450家族与亚家族的依据，并用数字 含有 P450结构域。对所获得 的 P450基 因在 ht— 和字母分别代表 P45O家族与亚家族的名字，同源性超 tp：／／www．cyped．uni—stuttgart．de／中，E—value 过4O 的为同一家族的基因成员，而同源性超过55 以 小于等于 1e 的情况下作 BLASTP比对，进行基因 上，则为同一亚族成员。P45O广泛分布于各种生物中， 家族和亚家族的命名。 1．2 P450基 因的分组 参与许多外源物质(如杀虫剂、环境有毒物质)和内源物 利用MEGA4．0对所有序列进行距离法 (Neighbor 质 (如激素、脂肪酸)的代谢 ，是重要的代谢酶系_2]，如昆 — Joiningmethod)系统树的构建，对系统树进化枝中的 虫的CYP6和 CYP9及 甲壳动物的CYP2都具有抗植物 基因根据氨基酸相似度大于 60％的标准分组。 毒素的功能，果蝇的CYP18和东亚飞蝗 CYP6H1分别 1．3 P450基 因正选择和基 因转换分析 参与蜕皮类固醇激素的代谢和活化。 本文 山的计算使用 PAML软件包中的eodeml程 家蚕 (Bombyxmori)属鳞翅 目蚕蛾科，普遍存在， 序，分别在不同的密码子替代模型M7和M8下进行计 广大桑农普遍饲养，是生态学、进化