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CellResearch(2009)19:282-295.
@2009IBCB.SIBS,CAS Allrightsreserved1001-0602/09$30.00
www.nature.com/cr
REVlEW
Epigenetics:heterochromatinmeetsRNAi
IngelaDjupedal,KarlEkwall
DepartmentofBiosciencesandMedicalNutrition.KarolinskaInstitutet,Sweden&SchoolofLifeSciences,UniversityCollege
SOdertOrn,NOVUM,14157Huddinge,Sweden
Theterm epigeneticsreferstoheritablechangesnotencodedbyDNA.TheorganizationofDNA intochrom atin
fibersafflectsgeneexpression inaheritablemannerandisthereforeonemechanism ofepigeneticinheritance.Large
partsofeukaryoficgenom esconsistofconstitutivelyhighlycondensedheterochromatin,importantformaintaining
genomeintegritybutalsoofrsilencingofgeneswithin.SmallRNA.togetherwithfactorsytpicallyassociatedwith
RNAinterference(RNAi)targetshomologousDNAsequencesandrecruitsfactorsthatmodifythechromatin,com-
mortlyresultinginform ation ofheterochrom atinandsilencingoftargetgenes.Thescopeofthisreview istoprovide
anoverview oftherolesofsmallRNA andtheRNAicomponents,Dicer,ArgonauteandRNA dependentpolymeras-
esinepigeneticinheritanceviaheterochromatin formation。exemplifiedwithpathwaysfrom unicellulareukaryotes,
plantsandanimals.
Keywords:epigeneticsheterochromatin,RNAi,siRNA,Argonaute,Dicer,RNA dependentpolymerase
CellResearch(2009)19:282—295.doi:10.1038/cr.2009.13:publishedonline3February2009
IntrOductiOn intoheterochromatinmostly consistsofnon—codingre—
peatsequences,andeuchromaticgenesthathappento
Ineukaryotes.theDNA iswrappedaroundhistone betranslocatedintoheterochromatin areepigenetically
proteins.formingchromatinfibersthatcoiluponthem. silenced.Thesegeneswerepresumedtobesilentdue
selvesforfurthercompaction.Thisarrangementaffects totheinaccessib
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