岷县、漳县产当归基于ITS序列的变异位点和分子进化分析.pdfVIP

岷县、漳县产当归基于ITS序列的变异位点和分子进化分析.pdf

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璃 仲鏖 2010年第23卷第12期GansuJournalofTCM,2010VoL23No.12 岷变 县\漳县产当归基于 ITS序列的 异位点和分子进化分析 王宏伟 ,,徐 燕 ,李海龙 z 1 甘肃中医学院附属医院,甘肃 兰州 730020;2 甘肃中医学院 摘 要 目的:建立甘肃当归功效的分子系统学基础,为甘肃当归 “道地性”提供分子依据。方法:采用PCR技术 获得 ITS基因,进行测序,经软件进行统计分析,计算各样本间的遗传距离并采用距离矩阵法构建 NJ系统发育树, 分析种群问的关系。结果:甘肃岷、漳两县当归ITS序列差异极小,分子进化分析显示岷漳两县产当归与欧当归的关 系较近,但不与当归属其他植物聚合,是当归属中一个特殊类群。结论:ITS序列特征可以作为当归种间鉴别的有效 分子标记,岷漳两县这种特殊的环境正是 “岷当归”这一特殊种群形成的主要原因。 关键词 当归;ITS;序列分析;道地性 中图分类号:R282.71 文献标识码:A 文章编号:i004-6852(2010)I2-0068-02 当归别名岷归 ,为伞形科多年生草本植物当归 ngelicasinensis 中1O分钟,取出后用研钵研细,筛网过滤后称 (Olw.)Diels]的干燥根。当归为著名常用中药,药用历史悠久,历代本草 取细粉 5Omg,然后按照上海生工产UN10--10 均有记载,始记于 奉《农本草经》,有补血活血、润肠调经之功效,是临床使 柱式植物基因组DNA抽提试剂盒提取,提取 用频率最高的中药之一,素有“十方九归’’之称。我国当归主产于甘肃东南 的基因组DNA一20℃保存,备用。 部,以岷县产量高,质量好,其次为云南,四川、陕西、湖北等省均有栽培【。 1.3 ITS序列扩增 以已经发表于genebank [== 甘肃是我国最大的当归产区,年产量 占全国的95%以上[,甘肃产的当 中的当归ITS序列为标准,设计一对引物,引 一一 归,个大质优,称 “秦归’ 西‘归”,销往全国并大量出口。2001年岷县被 物序列为:ITS正,6TTGTCGAATCCTGCAATAGC; 中国农学会授予“中国当归之乡’’称号。 ITS反,5,_TCG从GCGCACAGAGTATG (引物 由上 药材道地性研究已经成为中医药科研的重要课题,但由于道地药材 海生工合成)。PCR反应体系为5O ,其中 与非道地药材在形态和生药上基本一致,所以传统方法已不能满足道地 2xMaster25 ,上下游引物各5 ,模板 药材的现代研究。道地药材是一个地域性现象,其产生除了与栽培方法、 1 ,ddH2014 。PCR扩增条件:94C预变 生态环境、加工方法有关外,还与物种居群的遗传特异性有关。在植物系 性 1分钟,94℃变性 1分钟 ;53℃复性 1分 统与进化研究中,核酸分子量是最基本的进化单位,能反映进化本质;核 钟;72℃延伸 1分钟;共 35循环 ,72℃延伸 酸的基本序列是一元变化的,通常为点突破,趋同效应极小,以核酸分子 1O分钟,4C保存。 为指标确定的系统化关系不受主观因素影响。本实验将 ITS序列分析应 1.4 序列测定和分析 PCR产物经琼脂糖 用于甘肃中药材当归道地性的研究。 凝胶电泳检测后由上海生工测序,每个样品 1 材料与方法 均采用双向测序 。测序结果以已经发表于 1.1 实验材料 本实验所用材料均为2005年采 自甘肃省岷县及漳县地 genebank中的当归 ITS序列确定 ITS序列 区农民种植的当归种子,自然干燥后备用,实验材料经甘肃中医学院张西 的边界,并进行两端碱基手工修订。各序列特 玲教授鉴定后应用于实验。所用具体实验材料见表 1。

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