盐胁迫下西伯利亚蓼茎叶正反消减文库的构建及初步分析.pdfVIP

盐胁迫下西伯利亚蓼茎叶正反消减文库的构建及初步分析.pdf

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逢 HEREDITAS(Beijing)2009年4,El ISSN0253-9772 WWW.chinagene.crl 研究报告 DoI:1O.3724,s J.1005.2009.00426 盐胁迫下西伯利亚蓼茎叶正反消减文库的构建及初步 分析 刘关君,刘明坤,许志茹,阎秀峰,魏志刚,杨传平 东北林业大学林木遗传育种与生物技术教育部重点实验室,哈尔滨 150040 摘要:正向文库 以3%NaHCO3胁迫 48h的材料(茎、叶)为实验方(tester),以未胁迫的材料(茎、叶)为消减方 (driver);在负向文库中,以未胁迫的材料(茎、叶)为实验方(tester),以3%NaHCO3胁迫 48h的材料(茎、叶)为 消减方(driver),利用抑制性消减杂交技术(suppressionsubtractivehybridization,SSH)构建 了3%NaHCO3胁迫下 西伯利亚蓼茎叶正反消减文库。从文库中共获得 2282条有效EST序列,其中从茎正向消减文库 中获得598条, 从茎负向消减文库 中获得490条,从叶正向消减文库中获得627条,从叶负向消减文库 中获得567条 经BlastX 序列比对后,通过MIPs方法对 EST功能进行分类并对茎叶正反消减文库做 了比较,其中茎与叶部除细胞救援 与防御、转运组件 中变化趋势相同外,在代谢、能量、光合作用、蛋白合成、转录和信号传导等方面均表现为 相反趋势,另外通过荧光定量 RT-PCR对 12个潜在与盐胁迫相关基因进行定量分析,结果显示 12个基因在未 经胁迫与盐胁迫处理后的西伯利亚蓼叶与茎部有着很大差异,说明叶与茎部在NaHCO。条件下可能具有不同应 答机制与分工,这有助于进一步理解西伯利亚蓼分子耐盐机制。 关键词:西伯利亚蓼;消减文库;盐胁迫;差异表达基因 J · · ‘ 1 ’ ■ ● 00 1 1 1 』 ● 0nstructioU and analysisOIa I-orWard and reVerseSUbtraCnVe cDNA library from leaves and stem 0fPolygonum sibiricum Laxm .undersaltstress LIU Guan—Jun,LIU Ming—Kun,XU Zhi—Ru,YAN Xiu—Feng,WEIZhi—Gang,YANG Chuan-Ping TheLaboratoryoJ’ForestGeneticsandBreedingandBiotechnologyofMinistryofEducation,NortheastForestryUniversity,Harbin 150040,China Abstract:UsingcDNAspreparedfrom theleavesandstemsofPolygonum sibiricumLaxm.treatedwithNaHCO1stress for48hastestersandcDNAsrfom unstressed sibiricum leavesna dstemsasdrivers1ibrary,suppressionsubtractivehy. bridization(ssi-i)wasemployedtoconstructacDNA subtractedlibrary,whichcontained2282validsequencesincluding 598ESTsinthestemsforwardSSH libraryand490ESTsinhtestem reverseSSH library,627ESTsintheleafofrwrad SSH libraryand567inhteleafreverseSSH library.AccordingtohtefunctionalcatalogueofMIPsandthecomparisonof htereverseandforwradSSH librariesofthestem and1eaf,theresponsestoNaHC0 srtessweredifferentbetweenleafand stem ,exceptofrhtesametrendincellrescuedefensenadrtansportfacilitation.Thertendinthem

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