基础研究不同致龋性变形链球菌临床分离株差异ssDNA配基的.pdfVIP

·738 · doi 10.3969/j.issn. 1673-4254.2013.05.22 J South Med Univ, 2013, 33(5): 738-741 基础研究 不同致龋性变形链球菌临床分离株差异不同致龋性变形链球菌临床分离株差异ssDNAssDNA配基的筛选和鉴配基的筛选和鉴定定 1 1 2 3 1 1 1 3 3 3 4 4 王成龙 ，胡丹阳 ，刘佼佼 ，李少华 ，苏东华 ，席 庆 ，储冰峰 ，夏 伟 ，赵 强 ，丁红梅 ，罗燕萍 ，杨继勇 ， 1 1 3 邓 斌 ，徐 娟 ，邵宁生 1 4 2 3 解放军总医院 口腔科，微生物科；北京 100853；解放军沈阳军区总医院口腔内科，辽宁 沈阳 110840；军事 医学科学院基础医学研究所，北京 100850 摘要：目的筛选不同致龋性变形链球菌临床分离株差异ssDNA 配基并对其进行鉴定。方法 利用完整细胞为靶子的消减 SELEX技术筛选不同致龋性变形链球菌临床分离株差异ssDNA 配基，通过放射性同位素、流式细胞术、基因克隆测序、MEME 在线软件和RNA structue 分析软件分析配基的一、二级结构并对筛选得到的配基进行鉴定。结果 经过9 轮消减SELEX筛选， 放射性同位素检测文库已富集；流式细胞术检测经过测序和分析得到12条配基中的H 1、H 16、H4、L 1、L 10和H 19与高致龋变形 链球菌临床分离株特异结合，不与低致龋变形链球菌临床分离株特异结合，其中，H 19 的特异性结合程度最强，解离常数为 69.45±38.53 nmol/L。结论 筛选获得特异识别高致龋变形链球菌临床分离株的ssDNA配基。 关键词：变形链球菌；配基；筛选；鉴定 Selection and identification of ssDNA aptamers specific to clinical isolates of Streptococcus mutans strains with different cariogenicity 1 1 2 3 1 1 1 3 3 WANG Chenglong , HU Danyang , LIU Jiaojiao , LI Shaohua , SU Donghua , XI Qing , CHU Bingfeng , XIA Wei , ZHAO Qiang , DING 3 4 4 1 1 3 Hongmei , LUO Yanping , YANG Jiyong , DENG Bin , XU Juan , SHAO Ningsheng 1Department of Stomatology, 4Department of Microbiology, General Hospital of PLA, Beijing 100853, China; 2Department of Stomatology, General Hospital of Shenyang Military Command, Shenyang 110840, China; 3Beijing Institute of Basic Medical Sciences, Beijing 100850, China Abstract: Objective To select and identify ssDNA aptamers specific to Streptococcus mutans st