蛋白质侧链空间结构统计分析与预测应用.pdfVIP

摘 要 无论对于生命科学还是生物信息学，蛋白质空间结构的研究都是核心课题之一， 因为结构决定功能.而蛋白质侧链的空间结构研究是其中的一个重要分支.传统的 侧链结构研究还主要集中在单个氨基酸残基上，对于多个氨基酸残基的侧链结构研 究还不是很丰富. 本文以世界上广泛使用的生物分子三维结构数据库PDB为基础，利用沈世谧 教授提出的对多氨酸残基侧链碳原子间距离的统计分析方法，对蛋白质侧链的空间 结构进行了详细分析.通过正交试验设计和信息论中的嫡函数等相关知识，给出了 不同位置、不同氨基酸残基种类对侧链结构的影响，并从分子生物学角度进行了原 因分析，得出了侧链结构与化学键、疏水性的关系.本文还讨论了由侧链空间结构 预测蛋白质二级结构的可能性，得到了侧链长度的不同峰值范围与二级结构关系的 性质，为今后进行二级结构的辅助预测打下了基础. 关键词:蛋白质结构分析，侧链的空间结构，蛋白质二级结构，三联子，正交 试验设计:嫡函数 Abstract Theresearchofproteinspatialstructureisoneofthevitalsubjectsforboth GeneticsandBioinformatics,becausethestructure