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粤东地区橄榄种质资源遗传多样性的ISSR分析_论文网
导读::橄榄(Canariumalbum.L)。其遗传多样性水平也缺乏科学有效的评估。分析和电泳检测。对该地区橄榄种质资源一直缺乏系统的研究。关键词:橄榄,遗传多样性,ISSR,种质资源 橄榄(Canarium album.L),属于橄榄科(Burseraceae)橄榄属(Canarium),是我国南方重要的亚热带水果。其果实营养丰富,鲜食或加工均可,是卫生部批准的药食两用果品之一。粤东地区具有悠久的橄榄栽培历史并且保留了众多优质橄榄品种,当地至今仍保存着大量树龄达数百年的橄榄古树。但是,对该地区橄榄种质资源一直缺乏系统的研究论文网,其遗传多样性水平也缺乏科学有效的评估;同时粗放的种植和管理,导致一些优良的品种或特有的农家品种正逐渐减少或消失。因此,亟待开展相关的研究和保护。 近年来,随着PCR技术的发展,涌现出多种基于PCR的分子标记技术,并被广泛应用于植物种质资源亲缘关系以及遗传多样性的研究。其中,由Zietkiewicz等[1]提出的基于PCR的单引物ISSR(InterSimple Sequence Repeat)分子标记技术已在植物亲缘关系分析[2、3]、遗传多样性分析[4、5]、遗传图谱的构建[6]等方面广泛应用。DNA分子标记技术也被引入对橄榄的研究,如聂珍素[7]利用RAPD技术分析福建部分橄榄种质的亲缘关系;宋亚娜[8]通过ITS序列对14份福建橄榄进行鉴定和分类。本研究利用ISSR 标记技术对粤东地区64份橄榄种质的遗传多样性进行较为全面的调查研究以及评估,以期为该地区橄榄种质资源保护管理、核心种质建立以及进一步的育种计划提供相应的理论依据[F6]。 1. 材料和方法 1.1 材料来源 试验样品采集自粤东地区(汕头市、潮州市、揭阳市和梅州市),共计64份橄榄(Canarium album.L)种质(见表1)。采样时摘取无损伤的叶片,放入封口袋并用硅胶干燥保存。 1.2 主要试剂和仪器 主要试剂:Taq DNA 聚合酶、dNTP和100bp DNA Ladder Marker均购自TaKaRa(宝)生物工程(大连)有限公司;ISSR引物根据加拿大哥伦比亚大学(Univesity ofBritish Columbia, Set.No.9, No.801-900)提供的序列由北京赛百盛基因技术有限公司合成;琼脂糖购自西班牙Biowest公司;3S柱离心式琼脂糖DNA小量快速纯化试剂盒购自上海博彩生物科技有限公司。其他试剂为国产分析纯。 1.3 橄榄DNA提取 橄榄基因组DNA提取采用改良的CTAB法[9],并用DNA纯化试剂盒对DNA原液做进一步纯化,具体步骤如下:1.取0.1克左右的材料置于陶瓷研钵中并加入液氮,充分研磨,成粉末状。2.往研钵中加入65℃预热的2times;CTAB提取缓冲液论文网,将粉末状的材料研磨成匀浆并转入1.5ml离心管中,再加入适量的beta;巯基乙醇,充分混匀,在65℃水浴中保温30-40min,期间不时摇动混匀。3.将离心管中的匀浆分装到两个1.5ml离心管中,加入等体积的氯仿-异戊醇,充分混匀,室温静置5min,室温下10000r/min离心10min。4.重复步骤3一次或两次。5.取上清液加2-2.5倍体积的无水乙醇,小心摇动,出现沉淀,得粗DNA。短时离心后倒掉上清液,于沉淀中加1mol/L NaCl 400mu;L,待沉淀溶解后,加等体积氯仿:异丙醇(24:1)论文网,摇匀,室温静置5min,室温下10000r/min离心10min。6.去上清加2-2.5倍体积的无水乙醇,小心摇动,使DNA沉淀。7.短时离心去除上清,加入70%乙醇洗涤沉淀、风干。8.将DNA溶解于100mu;lTE缓冲液,待DNA完全溶解后再用快速纯化试剂盒对DNA溶液进行纯化。9.用1.0%琼脂糖凝胶电泳(1times;TAE)检测总DNA的质量,利用Biophotometer 生物分光光度计(德国 Eppendorf公司)测定DNA纯度和浓度,最后将DNA保存在-20℃冰箱里备用。 表1 供试橄榄种质材料 Table 1 Canarium album accessions used for[F7] this study 编号Code 品种Cultivar 采集地Locality 1
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