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上海交通大学硕士论文 中国人群组织特异性可变剪接体的鉴定 摘 要 真核生物中每个基因含有多个内含子和外显子，经过转录后生成 mRNA 前体，mRNA 前体通过可变剪接过程，将外显子选择性地组合、 连接在一起，形成不同的 mRNA。单个基因可以通过成熟 mRNA 所含外 显子的不同组合最终表达出功能各异的、甚至完全相反的蛋白质亚型。 可变剪接是指从一个 mRNA 前体中通过不同的剪接方式（选择不同的剪 接位点组合）产生不同的 mRNA 剪接异构体的过程。可变剪接使真核生 物的蛋白质变得十分丰富。据最近的估计有超过 60%的人类基因有超过 一个亚型。可变剪接是调节基因表达和产生蛋白质多样性的重要机制, 是导致人类基因和蛋白质数量较大差异的重要原因。因此，对可变剪接 的深入研究，对于理解生物过程调节、疾病发生和药物筛选等方面都极 其重要。 本研究选择了中国人群的血液、肝脏、胃、垂体和乳腺五种组织， 每种组织来自 3 个个体，采用 Affymetrix 的全基因外显子芯片，研究了 不同组织中的特异性表达的外显子和不同的剪接体。通过数据分析共发 现血液 272 个、胃 78 个、肝 123 个、乳腺 42 个、垂体 98 个特异性表达 上海交通大学硕士论文 的外显子，其中血液中特异性表达的外显子最多。用 RT-PCR 验证了 3 个基因的表达情况，结果与芯片的结果基本一致。 本研究筛选出的特异性表达的基因和外显子，需要进一步的功能学 分析，该研究结果为深入的分析这些基因的功能鉴定了基础。 关键词：外显子，可变剪接，全基因组外显子芯片，转录本 上海交通大学硕士论文 Identification of Tissue-specific Alternative Splicing of Chinese Population Using Human Whole Genome Exon Microarray ABSTRACT Each eukaroytic gene consists of introns and exons and is transcribed into pre-mRNA, from which different mRNAs are formed through alternative splicing with selectively combined exons. Different combinations of exons in mature mRNAs from one gene could result in funtionally different, even opposite, protein isoforms. Alternative splicing dramatically expands the protein-coding potential of higher eukaryotes. More than 60 % of human genes are estimated to have more than one isoform. Alternative pre - mRNA splicing is the most important mechanism for the regulation of gene expression and protein diversity. it is also one of the important reasons for the quantitative differences of genes and proteins in human being. Therefore the studying of alternative splicing is very important for perceiving gene regulation, disease development, and drug screening. 上海交通大学硕士论文 Using the whole genomic human exon microarray from Affymetrix, tissue-specific exons had been identified from tissues of blood, liver, stomach, pituitary, or breast taken from three normal Chinese individuals. Totally 272 blood-specific, 78 stomach-specific, 123 liver-specific, 98 pituitary-specific and 42 b