黑斑病菌诱导的紫薯抑制性差减杂交文库构建及ESTs分析_曾绍华.docVIP

2014 年 27 卷 1 期  西 南 农 业 学 报 Vol. 27 No. 1 Southwest China Journal of Agricultural Sciences 53  文章编号： 1001 － 4829（ 2014） 01 － 0053 － 06 黑斑病菌诱导的紫薯抑制性差减杂交文库 构建及 ESTs 分析  1  2  2 2  1 2  2*  （ 1． 四川农业大学，四川 成都 611130； 2． 四川省农业科学院生物技术核技术研究所，四川 成都 610066）  摘  要： 本研究以紫薯 1 号为材料，运用抑制性差减杂交（ SSH） 技术，构建了经黑斑病菌诱导 12、24、36、48、60 h 后的甘薯块根混 合 SSH cDNA 文库。随机挑取 103 个 cDNA 克隆进行 5＇端测序，共获得 87 个非重复序列，其中包括 29 个重叠群，58 个独立的 ES- Ts，利用 tblastx 对 87 个序列在 NCBI 数据库中进行同源性比对。结果表明，在编号为 14 的 EST 中找到了“蔷薇”黑斑抗性 muＲdr1 基因位点，基因全序列包括 muＲdr1A、muＲdr1B、muＲdr1C、muＲdr1D、muＲdr1E、muＲdr1F、muＲdr1G、muＲd