基于16S rDNA序列和RFLP分析的病鳗分离菌株鉴定.pdfVIP

第 l7卷 第2期 集美大学学报 (自然科学版) V01．17 No．2 2012年3月 joumalofJimeiUniversity(NaturalScience) M81．2012 [文章编号]1007—7405(2012)02—0081—08 基于 16SrDNA序列和RFTP分析的病鳗分离菌株鉴定 郭松林 ，关瑞章 ，冯建军 ，杨求华 ，‘ (1．集美大学水产学院，福建 厦门361021；2．教育部鳗鱼产业技术工程研究中心，福建 厦门361021) [摘要】结合 16SrDNA基因序列和限制性片段长度多态性 (RFLP)的分析方法，通过与 GenBank库 中已递交的细菌 16SrDNA基因序列进行同源性比较 ，对分离 自发病鳗鲡 (欧洲鳗鲡 ，日本鳗鲡和美洲鳗 鲡)的3O株细菌进行初步鉴定和分类．结果表明，这些细菌可大致分为气单胞菌属 (Aeromonas8p．)、假 单胞菌属 (Pseudomonas8p．)、邻单胞菌属 (Plesiomonassp．)、克雷伯氏菌属 (Klebsiella8p．)、柠檬酸杆 菌属 (Citrobacter8p．)、不动杆菌属 (Acinetobacter8p．)和肠杆菌属 (Enterobacter叩．)等7个茵属．分析认 为，部分分离菌株可能是引起鳗鲡病害的疑似致病性菌株． [关键词】鳗鲡；细菌；16SrDNA；RFLP；鉴定 [中图分类号】Q959 [文献标志码】A Identification ofBacteriaIsolatedfrom DiseasedEelsUsing 16SrDNA PCR |RFLPAnalysis GUOSong—lin ，GUANRui．zhang ，FENGJian-jun ，YANGQiu—hua， (1．FisheriesCollege，JimeiUniversiyt，Xiamen361021，China；2．EngineeringResearchCenterof EelIndustrialTecihnology，MinistryofEducation，Xiamen361021，China) Abstract：Using16SrDNAgenesequencesandrestrictionfragmentlengthpolymorphism (RrLP)a· nalysis，thestudyinitiallyidentified：30strainsofbacteriaisolatedfromEuropeaneel(Anguillaanguilla)， Japaneseeel(Anguillajaponica)andAmericaneel(Anguillarostrata)accordingtothehomologycompari- SOnwiht bacterial16SrDNAgenesequencewhichhadbeensubmittedintotheCeneBankdatabase．There- suitsshowedhtathte30bacteriacouldbebroadlydividedinto7genera，includingAeromonassp．，Pseudo— moRa,$sp．，P／es／omonas叩．，Klebshlla sp．，Citrobactersp．，Acinetobactersp．andEnterobactersp．Re— suitsofhtestudyindicatedsomeoftheisolatescouldbesuspectedaspahtogenicstrainswhichcauseddiseases toeels． Keywords：eel；bacteria；16SrDNA；RFLP；identification O 引言 细菌性疾病是 目前严重危害鳗鲡养殖的一类主要疾病，对这些病原菌进行快速鉴定，采取恰当的 防治措施来控制其引发的疾病具有较大的应用价值．细菌性疾病诊断主要有传统的鉴定方法和分子生 [收稿 日期]2011—10—20