粪便DNA论文：越冬白头鹤种群遗传多样性的初步研究.docVIP

粪便DNA论文：越冬白头鹤种群遗传多样性的初步研究 【中文摘要】白头鹤是IUCN红色物种名录中的濒危物种,需要加强种群保护遗传学的研究。本文以粪便为研究材料,通过高质量粪便DNA样品的提取,对白头鹤个体(来自3个不同地区即升金湖、菜子湖、鄱阳湖自然保护区)的线粒体基因组控制区序列进行测定和群体遗传分析。(1)以1103bp左右长度的线粒体控制区DNA序列进行分析,获得38条线粒体控制区序列,序列比对后共检测到12个变异位点,定义12种单倍型,其中2种为安徽(菜子湖、升金湖)和鄱阳湖两个种群所共有,10种为各个种群所特有。从Genebank下载两条白头鹤线粒体控制区序列,增加了2种单倍型。白头鹤两个种群总单倍型多样性(h)为0.784,核苷酸多样性(π)为0.00128,核苷酸差异均数(k)为1.414。(2)安徽种群(菜子湖、升金湖)和鄱阳湖种群的单倍型多样性分别为0.802、0.679,核苷酸多样性分别为0.00143、0.00071,核苷酸差异均数分别为1.572、0.786。相对于鄱阳湖种群,安徽种群(菜子湖、升金湖)的单倍型多样性、核苷酸多样性、核苷酸差异均数相对较高。中性检验和歧点分布检验(SSD=0.00879,P=0.16)均表明白头鹤在历史上发生过种群扩张事件,时间约在17916年前。分子变异分(Analysis of Molecular Variance, AMO