【免费】代谢组学的研究策略与方法新进展.pdfVIP

第 37卷 分析化学 ( FENX I HUAXU E) 　评述与进展 第 1期 　　　　　 　　　　　　 　　　　　 　　　　　　 2009年 1月 Ch inese Jou rnal of A nalytical Chem istry 136～143 评述与进展 代谢组学研究策略与方法的新进展 1, 2 2 3 2 1, 2 夏建飞 　梁琼麟 　胡 坪 　王义明 　罗国安 1 ( ) 2 ( ) 华东理工大学药学院 ,上海 200237 　　　 清华大学分析中心 ,北京 100084 3 (华东理工大学化学与分子工程学院 ,上海 200237) 摘 　要 　代谢组学研究的是生物体系受到内在和外在因素刺激产生的内源性代谢变化 ,可以对那些能描述 代谢循环情况的关键化合物进行定性和定量分析 。近几年来 ,代谢组学已经成为生命科学领域一个重要的、 有价值的工具 ,并在不断创新的分析技术推动下稳步发展 。虽然代谢组学本身还存在一些不足 ,但许多研究 者以解决问题为出发点 ,提出了一些新的研究策略、方法和技术 。代谢组学发展呈现出整合一体化 ,定量化和 标准化的趋势 。本文对代谢组学的概况 ,现在的发展情况和未来的趋势进行综述 。 关键词 　代谢组学 ,研究策略 ,分析方法 ,综述 1　代谢组学的概况 ( ) 代谢组学 m etabonom ic s 是以组群指标分析为基础 , 以高通量检测和数据处理为手段 , 以信息建模 与系统整合为 目标的系统生物学的一个分支 ,是继基因组学 、转录组学 、蛋白质组学后系统生物学的另 一重要研究领域 , 它是研究生物体系受外部刺激所产生的所有代谢产物变化的科学 ,所关注的是代谢 循环中分子量小于 1000 的小分子代谢物的变化 ,反映的是外界刺激或遗传修饰的细胞或组织的代谢应 答变化 [ 1 ] 。代谢组学的概念最早来源于代谢轮廓分析 [ 2 ] 。N icho lson 研究小组于 1999 年提出了代谢组 学的概念 [ 1 ] , 并在疾病诊断、药物筛选等方面做了大量的卓有成效的工作 [ 3～5 ] 。F iehn 等 [ 6 ] 提出了 m etabo lom ic s的概念 ,第一次把代谢产物和生物基因的功能联系起来 ,之后很多植物化学家开展了植物 代谢组学的研究 , 使得代谢组学得到了极大的充实 , 同时也形成了当前代谢组学的两大主流领域 : [ 6, 7 ] [ 8 ] [ 9 ] [ 10, 11 ] m etabo lom ic s和 m etabonom ic s。经过不断发展 , F iehn 、A llen 、N ielsen , V illa sBoa s 等确定了 代谢组学一些相关层次的定义 , 已被学术界广泛接受 。第一个层次为靶标分析 , 目标是定量分析一个靶 蛋白的底物和 /或产物 ;第二个层次为代谢轮廓分析 ,采用针对性的分析技术 ,对特定代谢过程中的结构 或性质相关的预设代谢物系列进行定量测定 ;第三个层次为代谢指纹 /足印 ,定性并半定量分析细胞外 / 细胞内全部代谢物 ;第四个层次为代谢组学 ,定量分析一个生物系统全部代谢物 ,但 目前还难以实现 。 作为应用驱动的新兴科学 ,代谢组学已在药物毒性和机理研究[ 12 , 13 ] 、微生物和植物研究[ 14 ] 、疾病诊 断和动物模型 [ 15, 16 ] 、基因功能的阐明[ 1