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分子动力学实验报告实验名称 平衡晶格常数和体弹模量实验目的1、学习Linux系统的指令2、学习lammps脚本的形式和内容实验原理原子、离子或分子在三维空间做规则的排列,相同的部分具有直线周期平移的特点。为了描述晶体结构的周期性,人们提出了空间点阵的概念。为了说明点阵排列的规律和特点,可以在点阵中去除一个具有代表性的基本单元作为点阵的组成单元,称为晶胞。晶胞的大小一般是由晶格常数衡量的,它是表征晶体结构的一个重要基本参数。在本次模拟实验中,给定Si集中典型立方晶体结构:fcc,bcc,sc,dc。根据可判定dc结构是否能量最低,即是否最稳定材料在弹性变形阶段,其应力和应变成正比例关系(即符合胡克定律),其比例系数称为弹性模量。弹性模量是描述物质弹性的一个物理量,是一个总称,包括杨氏模量、剪切模量、体积模量等。在弹性变形范围内,物体的体应力与相应体应变之比的绝对值称为体弹模量。表达式为式中,P为体应力或物体受到的各向均匀的压强,为体积的相对变化。对于立方晶胞,总能量可以表示为,E为单个原子的结合能,M为单位晶胞内的原子数。晶胞体积可以表示为,那么压强P为故体积模量可以表示为根据实验第一部分算出的平衡晶格常数,以及能量与晶格间距的函数关系,可以求得对应晶格类型的体积模量。并与现有数据进行对比。实验过程(1)平衡晶格常数将share文件夹中关于第一次实验的文件夹拷贝到本地,其中包含势函数文件和input文件。$ cp□-r□share/md_1□.$ cd□md_1$ cd□1_lattice通过LAMMPS执行in.diamond文件,得到输出文件,包括体系能量和cfg文件,log文件。$ lmp□-i□in.diamond用gnuplot画图软件利用输出数据作图,得到晶格长度与体系能量的关系,能量最低处对应的晶格长度即是晶格常数。Si为diamond晶格结构时晶格长度与体系能量关系图如图,由图可得能量最小处对应取。Si为fcc晶格结构时晶格长度与体系能量关系图如图,。改写后的sc、bcc脚本文件分别如图所示Si为sc晶格结构时晶格长度与体系能量关系图如图,。Si为sc晶格结构时晶格长度与体系能量关系图如图,。(2)体弹模量利用gnuplot的二次拟合功能,对上述步骤中得出的晶格常数与体系能量关系图进行二次拟合,f(x)=a+b*x+c*x**2fit□f(x)□‘data’□via□a,b,c得到各晶格结构下的二次拟合函数表达式中的系数a,b,c,如图Si在diamond结构下的拟合结果Si在fcc结构下的拟合结果Si在sc结构下的拟合结果Si在bcc结构下的拟合结果结果与分析(1)平衡晶格常数由实验过程中所得的各个关系图可知:Si在diamond结构下,平衡晶格常数为5.43095×10-10m,对应能量约为-936.706eV;Si在fcc结构下,平衡晶格常数为4.110-10m,对应能量约为-420eV;Si在sc结构下,平衡晶格常数2.6110-10m,对应能量约为-109.65eV;Si在bcc结构下,平衡晶格常数为3.24510-10m,对应能量约为-219eV;从以上对比可得,Si能量为-936.706eV时为最小值,即对Si来说,diamond结构最稳定,且此时平衡晶格常数为5.43095×10-10m。(2)体弹模量由体弹模量计算公式得。由此公式计算得:Si在diamond结构下,M=8,a0=5.43095,c=417.69,得B=10953.23684GPa;Si在fcc结构下,M=4,a0=4.1,c=2122.6,得B=36865.36282GPa;Si在sc结构下,M=1,a0=2.61,c=201.149,得B=1371.99203GPa;Si在bcc结构下,M=2,a0=3.245,c=359.335,得B=3942.65733GPa;实验结论 通过本次实验,我们在计算不同结构下的单晶硅的平衡晶格常数与其对应能量,发现单晶硅在diamond结构下最为稳定。在diamond结构下,单晶硅的平衡晶格常数为5.43095×10-10m,对应能量约为-936.706eV,体弹模量为10953.23684Gpa。在Si为diamond晶格结构时晶格长度与体系能量关系图中有一条首尾相连的直线,可能为在课余时间多次计算而产生的。在不同结构下体弹模量的误差较大,可能为拟合过程中产生的了一定的误差,应该尝试更高次数的拟合方程。实验名称 晶体点缺陷实验目的利用分子动力学方法构建和研究fcc 晶体Cu 的点缺陷,空位和间隙原子,并利用以上公式计算空位形成能和间隙原子形成能。实验原理晶体中的缺陷包括从原子、电子水平的微观缺陷到显微缺陷。按几何形态来分类,点缺陷是零维缺陷,这种缺陷在各个方向上的延伸都很小,仅发生在晶格中的
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