猪繁殖与呼吸综合征病毒柳州地方株NSP2和ORF5基因变异分析.pdfVIP

中国动物检疫 2011 年第28 卷第11 期 - 3535 - 猪繁殖与呼吸综合征病毒 柳州地方株NSP2 和ORF5 基因变异分析 韦正吉，陈强，严斯刚 （广西柳州市动物疫病预防控制中心，广西柳州 545005） 摘 要：为了给广西柳州预防和控制猪繁殖与呼吸综合症提供理论数据，本研究对利用RT-PCR 方法扩增了该地区流行株 LZ5 和LZ6 的NSP2 和ORF5 基因并进行测序分析，然后与GenBank 中已发表的PRRSV 毒株的NSP2 和ORF5 基因序列进行比 较。结果显示，2 株柳州地方流行株均属于美洲型，在NSP2 基因第483 位和535~563 位氨基酸均存在30 个氨基酸的不连续缺 失，其NSP2 和ORF5 基因的核苷酸同源性分别为99.5%和99.7% ，推导的氨基酸同源性分别为100%和99.5% ；与近几年国内流 行的高致病性蓝耳病代表性毒株之间的NSP2 、ORF5 基因核苷酸同源性分别为94.7%~96.2%和97.2%~98.0%，其推导的氨基酸同 源性分别为92.0%~95.5%和94.5%~97.0%。序列分析结果表明此次柳州流行的PRRSV 与2006 年夏高热病引起的基因序列高度 同源，在基因序列上并未显示出新的特性，在国内也缺乏明显的地域性差异。 关键词：猪繁殖与呼吸综合症；NSP2 基因；ORF5 基因；变异分析 中图分类号：S852. 659. 6 文献标识码：A 文章编号：1005- 944X（2011）11- 0035- 04 Variation Analysis of Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus NSP2 and ORF5 Genes of Liuzhou Strains Wei Zhengji ，Chen Qiang，Yan Sigang （Liuzhou Center for Animal Disease Prevention and Control ，Liuzhou ，Guangxi，545005，China） Abstract ：In order to offer the theoretical data for prevention and control of PRRS endemic in Liuzhou region ，the partial NSP2 and ORF5 genes of PRRSV LZ5 and LZ6 strains were amplified by RT-PCR and sequenced.The obtained sequences were analyzed and compared with the published nucleotide sequences of other strains in GeneBank by DNAstar software.The results showed that the two strains were classified into the North American type of PRRSV.The partial NSP2 gene shared a common feature of two distinctive deletions in 483 and 535-563 amino acid ，a 30 amino acids deletion in NSP2 were found. Sequence comparison of partial NSP2 and ORF5 gene revealed a sequence homology of 99.5% and 99.7% between them ，with a similarity of 100% and 99.5% in deduced amino a