耐辐射球菌中以PprI为基础的DNA损伤修复网络的初步研究.pdfVIP

中文摘要 耐辐射球菌(Deinococcus 抗辐射能力最强的生物之一。虽然对它的特殊抗性机制有近50年的研究历史， 但对于其中的分子机制仍知之甚少。最近我们实验室在耐辐射球菌电离辐射敏感 株中鉴定了一个与电离辐射抗性相关的基因pprI,该基因可能通过调控DR细菌 recA、pprA等基因的表达加速对电离辐射引起的DNA损伤修复，而在大肠杆菌 化能力明显增强，这将为我们理解其特殊抗性机制，特别是双链断裂修复提供新 的线索。为了深入地理解PprI的功能，本文综合运用了生物信息学、存活率分 析、蛋白质组学等技术手段。并在此基础上，以大肠杆菌和酵母为参考用生物信 息学手段初步研究了耐辐射球菌中DNA双链断裂修复网络，认为在这个网络中 PprI、RecA和PprA起着非常重要的作用。具体结果如下： 1．pprI的生物信息学分析：pprI是4个紧密相连基因的第一个基因，后面 的三个分别是如护、如旧、如Ⅸ的同源物，它们参与叶酸的生物合成，因此ppH G+C含量为69％，比DR全基因组 在基因组中的位置有点特殊。分析表明pprl (66．6％)，染色体I(67％)稍微高点，且其密码子偏好性与全基因组中情况很 相似