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实验七 SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳 测定蛋白质分子量 一、实验目的 学习SDS测定蛋白质分子量的原理 掌握垂直板电泳的操作方法 二、实验原理 聚丙烯酰胺凝胶是由单体丙烯酰胺(acrylamide，简称Acr)和交联剂N,N-甲叉双丙烯酰胺(methylene-bisacrylamide,简称Bis)在催化剂和加速剂的作用下聚合并联成三维网状结构的凝胶，以此凝胶为支持物的电泳称为聚丙烯酰胺凝胶电泳(polyacrylamide gel electrophoresis，简称PAGE)。 SDS即十二烷基硫酸钠是阴离子去污剂，与大多数蛋白质平均结合比为1.4g SDS/g蛋白质。由于SDS带有大量负电荷，当其与蛋白质结合时，所带的负电荷大大超过了天然蛋白质原有的负电荷，因而消除或掩盖了不同种类蛋白质间原有电荷的差异，使蛋白质均带有相同密度的负电荷，因而可利用分子量差异将各种蛋白质分开。 在蛋白质溶解液中，加入SDS和疏基乙醇，巯基乙醇可使蛋白质分子中的二硫键还原，使多肽分成单个亚单位。SDS可使蛋白质的氢键、疏水键打开，还引起蛋白质构象的改变。SDS-蛋白质复合物在水溶液中的形状近似雪茄形的长椭圆棒。不同蛋白质-SDS复合物的短轴相同 ，约1.8nm，而长轴则与蛋白质的Mr成正比。 蛋白质分子的迁移速度只取决于分子大小。分子量在15KD到200KD之间时，lgMr=K-b*mR 浓缩效应 （1）凝胶孔径的不连续性：在上述凝胶中，浓缩胶为大孔胶；分离胶为小孔胶。在电场作用下，样品颗粒在大孔胶中泳动的阻力小，移动速度快；当进入小孔胶时，受到的阻力大，移动速度减慢。因而在两层凝胶交界处，样品迁移受阻而压缩成很窄的区带。 （2）缓冲体系离子成分及pH值的不连续性： 浓缩胶pH6.8，Tris-Cl 0.5 mol/L；三羟甲基氨基甲烷 分离胶pH8.8，Tris-Cl 1.5 mol/L 电极缓冲液pH=8.30，为Tirs-Gly缓冲液 浓缩胶，pH6.8，蛋白质分子的迁移率比Cl- 低，比Gly高。 （3）电位梯度不连续性：快离子（ Cl- ）后面形成高电位梯度区，慢离子（Gly）前面形成低电位梯度区，高电位梯度和低电位梯度之间的地方，形成一个稳定而不断向阳极移动的界面，蛋白质分子在界面处浓缩成一个狭小的中间层。 这种在电泳开始后产生的高电位梯度作用于蛋白和甘氨酸慢离子加速前进，追赶快离子。本来夹在快慢离子之间的蛋白区带，在这个追赶中被逐渐地压缩聚集成一条更为狭窄的区带。 在pH8.9的分离胶中，各种带净电荷不同的蛋白质有不同的迁移率。净电荷多，则迁移快； 反之，则慢。 SDS-蛋白质复合物电荷密度相同，静电荷量与蛋白质分子量成相关。 三、实验试剂 (7) 2?样品缓冲液 SDS、 甘油、巯基乙醇、溴酚兰 (8) 2?电极缓冲液母液（pH8.3） Tris，Gly，SDS (9) 染色液（考马斯亮蓝染料） (10) 脱色液 甲醇、冰醋酸 水溶液 四、实验步骤 五、实验结果分析 绘制标准曲线：log Mr = K - bmR  蛋白质区带中心至分离胶上沿距离 相对迁移率= 溴酚蓝至分离胶上沿距离 以每个蛋白标准的分子量对数作纵坐标，相对迁移率作横坐标，作标准曲线，然后在计算出待测蛋白的迁移率即可在标准曲线上查出其分子量。 六、思考题 在SDS中，当分离胶加完后，在其上加一层正丁醇的目的是什么? 在SDS中分离胶与浓缩胶中均含有TEMED和APS, 试述其作用? 解释浓缩效应和分子筛效应。 * ?蛋白质离子进入分离胶后，条件有很大变化。由于其pH 升高(电泳进行时常超过9.0)，使Gly 解离成负离子的效应增加；同时因凝胶的浓度升高，蛋白质的泳动受到影响，迁移率急剧下降。此两项变化，使Gly 的移动超过蛋白质，上述的高电压梯度不复存在，蛋白质便在一个较均一的pH 和电压梯度环境中，按其分子的大小移动。 分离胶的孔径有一定的大小，对不同相对分子质量的蛋白质来说，通过时受到的阻滞程度不同，即使净电荷相等的颗粒，也会由于这种分子筛的效应，把不同大小的蛋白质相互分开。 分子筛效应 电荷效应 低分子量标准蛋白（protein marker）： 兔磷酸化酶B MW=94000  牛血清白蛋白 MW=66200 兔肌动蛋白 MW=45000 牛碳酸酐酶 MW=33000 蛋