ZNF92的生物信息学分析王仕佳.docVIP

ZNF92的生物信息学分析 所谓的C2H2型锌指蛋白，是一种经典的锌指结构。它由1个α-螺旋和2个反平衡的β-折叠三个肽段组成，其N端有一组半胱氨酸残基，C端有一组组氨酸残基，四个残基在空间上形成一个洞穴，恰好容纳一个Zn2＋，形似手指。锌离子能够稳固模体中的α-螺旋结构，使其能够镶嵌于DNA的大沟上。 ZNF92属于Kruepel C2H2型锌指蛋白家族，含有16个锌指结构并含有一个KRAB区域。 一 锌指蛋白家族通过结合核酸方面起到很多主要作用，其中一个最重要的作用就是调节转录。Bellefroid et al 在1991年从互补ＤＮＡ文库中筛选出带有编码序列ＺＮＦ８５氨基末端非指端区域（里面有ＫＲＡＢ区域）的人类未分化胚胎瘤中分离出含有ZNF92锌指蛋白编码基因片段的一类编码基因区。Bellefroid et al 命名为ZNF91 家族，其中包括ZNF92。这类蛋白含有在氨基末端KRAB区域和第一个指单位之间的保守连接区域，称为ZNF91 间隔区。同时他还发现ZNF91家族在人体组织中存在高表达，特别是在T淋巴细胞中。通过体细胞杂交分析以及荧光素原位杂交，Bellefroid et al 测定了ZNF92 基因位于19p13.1-p12内。 但是该基因与疾病的关系未知。 二 从 http://www.ebi.ac.uk/Tools/InterProScan 我们进行蛋白功能域的分析和预测得出 特异性β1糖蛋白Wilms瘤抑癌基因/calc_mw_pi.html 我们输入蛋白序列便得到了目的蛋白基因的分子质量和等电点。 # Phosphates Molecular Weight Isoelectric Point 0 68568.8509 9.40 1 68646.8149 9.37 2 68724.7789 9.33 3 68802.7429 9.30 4 68880.7069 9.26 5 68958.6709 9.22 6 69036.6349 9.18 7 69114.5989 9.14 8 69192.5629 9.10 从表上我们可以看到，每增加一个磷酸化，分子量增加78~122，而等电点却会下降近乎0.3~0.4。 四 从/predictNLS/ 我们进行核定位信号区的预测和分析，结果表明蛋白基因不包含核定位信号区。 五 从 http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/ 进行信号肽切割位点序列的预测 我们得到 从图中我们可以预测出此蛋白不是个促分泌的蛋白。 六 从 http://www.cbs.dtu.dk/services/NetOGlyc/ 进行 O型糖基化修饰分析 Name S/T Pos G-score I-score Y/N Comment ---------------------------------------------------------------------------- ZNF92 T 5 0.308 0.048 . - ZNF92 S 14 0.095 0.031 . - ZNF92 T 23 0.100 0.045 . - ZNF92 S 48 0.089 0.195 . - ZNF92 T 54 0.155 0.062 . - ZNF92 T 74 0.206 0.028 . - ZNF92 S 79 0.132 0.060 . - ZNF92 S 90 0.129 0.025 . - ZNF92 S 94 0.123 0.018 . - ZNF92 T 102 0.129 0.052 . - ZNF92 S 119 0.077 0.