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1IL-1、TNF-α基因多态性与汉人Alzheimer病的相关性研究.pdf
山西医科大学硕士学位论文
电泳仪 北京六一仪器厂
PCR扩增仪(PTC一9600) 美国PE公司。
紫外凝胶图象分析系统GDS7500(UVP)德国
二、 方法
2.1基因组DNA提取
采用低渗溶血、常规酚一氯仿法提取白细胞基因组DNA(见附录2)。
2.2 apoE基因型检测
25nmaol/L
10XPCR反应缓冲液;1.59l
PCR反应体系为259l,O.5一IggDNA模板;2.59l
2mmol/Ld DNA
MgCL2;2.51alDMSO;lgl
聚合酶2U。PCR反应程序为:960C5min,30周期(94。CImin,63。C50s,72。C1min),
720C10min。取PCR产物(292bp)(图1)109I,加5U
变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离酶切产物,银染并观察、摄影。其消化后的基因产物有6种
2.3 IL一1
d(-8890/T)基因型检测
25
10XPCR反应缓冲液:39l
CATO一3:PCR反应体系为409l,O.5—199DNA模板:49l
mmol/L 2mmol/L DNA聚合酶
MgCL2;2p_l dNTPs;10pmol/L上下游引物各29l;Taq
40s,56。C40s,72。C50s),72。C10
1.5U。PCR反应程序为:960C5min,40周期(940C
min。取PCR产物(99bp)(图3)159l,加5U
性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离酶切产物,银染并观察、摄影。其消化后的基因产物有3种基
bp、83bp、16bp三个片断是杂合予基因型C/T。(图4)。
2.4 I L一1RaVNTR检测
应体系为209l,0.5—11.tgDNA模板;2ul10XPCR反应缓冲液;19l
DNA聚合酶1U。PCR反应程序为:
gl2mmol/IxtNTPs:10pmol/L上下游引物各19l:Taq
950C4min,30周期(940C
2.5 TNF—Q(-308A/G)基因型检测
山西医科大学硕士学位论文
10XPCR反应缓冲液;
ATTCCG一3:PCR反应体系为409l,0.5--199DNA模板;49l
25mrnol/L 2nlnlol/L DNA聚
3肛l MgCLz29l dNTPs;10pmol/L上下游引物各29hTaq
合酶1.5U。PCR反应程序为:94。C3min,30周期(94。C
8min。取PCR产物(107bp)(图6)159l,加5U
性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离酶切产物,银染并观察、摄影。结果有三种基因型:只有107
个条带为杂合子G/A(图7)。
2.6 统计学方法
and
基因频率及等位基因频率以百分率(%)表示,组间比较用f检验。用Cochran’S
Mantel—Haenszel
检验。全部材料采用SPS
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