长豇豆（V.sesquipedalis）SSR反应体系的建立.pdfVIP

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2017-09-01 发布于河北
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长豇豆（V.sesquipedalis）SSR反应体系的建立.pdf

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维普资讯研究报告彭海等：长豇豆 ( sesquipedalis)SSR反应体系的建立长豇豆 ( sesquipedalis)SSR反应体系的建立彭海，张静，徐凡，陈禅友 (江汉大学生命科学学院，湖北武汉430056) 摘要：对长豇豆SSR反应中模板、引物、dNTP和酶的浓度进行了正交设计分析，结果表明，引物浓度对长豇豆SSR扩增影响明显，其它3种成分浓度没有显著影响，基因组差异亦对反应没有明显影响。通过进一步引物浓度实验并结合成本考虑，确定长豇豆SSR反应成分的最佳浓度为：模板 1ng／L、引物 1．6~／mol／L、dNTP各 100~／M／L、Taq聚合酶0．5U。文中还对长豇豆SSR引物浓度对扩增效率的影响进行了讨论。本研究为利用SSR分子标记分析长豇豆遗传关系奠定了基础。关键词：长豇豆；SSR标记；引物；反应体系中图分类号： $643．4 文献标志码： A 文章编号： 1001-4705(2007)10-0039-03 TheEstablishmentofSSRReactionSystemforAsparagusBeans( sesquipedalis) PENG Hai，ZHANG Jing，XU Fan，CHEN Chan-you (CollegeofLifeSciences，JianghanUniversity，Wuhan430056，China) Abstract：Wetestedfortheproperconcentrationsoftemplate，primer，dNTPandenzymebyanorthogonal de— sign experiment．Theresultshowedthathtedifferencebetweengenomedidnotobviouslyaffecthteefficiencyof asparagusbean SSR amplification．Thefurtheranalysisrevealedthatonlyhteprimerconcentrationwashtekey factorofrhteefficiencyofSSR amplification．TakingtogehtercostofSSR analysisandhteresultsofthefollow— ingexperimentsofrprimerconcentration，we determinedhteoptimalconcenrtationsofrasparaugsbean SSR amplification．Namely，hte concenrtationsofprimer，template，dNTP andTaqpolymerasewere1．6／xmol／L， 1ng／L，100I~M／Land0．5U，respectively．TheSSRprimerconcenrtationwerediscussedinthepaper．This studysetupafoundationofrhtegeneticanalysisofasparaug sbeanwiht SSR technique． Keywords： sparaug sbena ；SSRma~er；primer；reaction system 豇豆 [Vignaunguiculata(L_)Walp]起源于非另外有一个亚种为普通豇豆( unguiculata)，故豇豆洲，传人亚洲后，在中国与印度分别形成了长豇豆共有 3个亚种。中国是长豇豆的多样性中心与次生起 ( sesquipedalis)与短豇豆( cylindrica)两个亚种，源中心…。