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DNA条形码的研究与应用 DNA条形码的原理:DNA是生物的遗传信息载体,遗传物质的不同,决定了生物的多样性。由于每种生物物种的DNA序列都是唯一的,就给DNA条形码提供了物质基础。 由于部分碱基的保守性,几十个碱基的长度不能提供足够的编码信息,因此目前的DNA条形码分析都是基于几百个碱基长度的DNA序列。 二、DNA条形码的特点及优势 1、利用小块生物体组织进行鉴别 2、能够在生物的不同生长阶段鉴别物种 3、准确地辨别形态相似性很高的物种 4、减少鉴别的模糊性 5、鉴别过程更加迅捷 6、鉴别过程无限制 7、在分类领域开展了用电子技术处理的新方向 8、对生命之树新的贡献 9、展示出收藏样本的价值 10、完善生命的百科全书 NP探针 MMP探针 其他受到关注之处还包括: * * 主讲人:程 利 专业:渔业 学号:14095108210001 应用 特点及优势 定义与原理 DNA条形码 2003年,Paul Hebert等对动物界包括脊椎动物和无脊椎动物共11门13 320个物种的线粒体细胞色素c氧化酶亚基1(Cytochrome coxdase I,CO I)基因序列比较分析,发现98%的物种遗传距离差异在种内为0%-2%,种间平均可达到11.3%,据此提出可以用单一的小片段基因来代表物种。 因此,他们将超市用以区分成千上万种不同商品的条形码概念引入,把这种小片段基因序列称作物种的DNA条形码(DNA barcodes),并提出为全球生物编码的计划。 发现 二、DNA条形码的概念及原理 DNA Barcoding的概念由加拿大动物学家Paul Hebert首次提出。 DNA条形码技术(DNA barcoding)是利用标准的、有足够变异的、易扩增且相对较短的DNA片段(DNA barcode)自身在物种种内的特异性和种间的多样性而创建的一种新的生物身份识别系统,它可以对物种进行快速的自动鉴定。 Back Back 应用实例:利用生物条形码技术对蓝舌病毒VP7蛋白进行微量检测 方法:制备VP7蛋白的多抗及特异DNA链标记的金纳米颗粒探针(NP)和VP7蛋白单抗标记的磁性微球探针(MMP),形成MMP-VP7蛋白-NP三明治复合物后,再利用去杂交将NP探针上标记的DNA链释放出来,通过PCR或芯片检测方法鉴定释放的DNA链,确定VP7蛋白的存在。 结果:建立了蓝舌病毒VP7蛋白的生物条码检测体系,检测灵敏度可达10fg/mL,为常规ELISA检测的106倍。 结论:为发展高灵敏度的蓝舌病毒生物条形码检测试剂盒鉴定了基础。 NP探针是双链DNA包被交替金颗粒和抗被检物的多克隆抗体,双链DNA的1条和胶体金颗粒通过Au-S键相连,另一条DNA用来指示被检物的条形码DNA。 MMP探针是对应着分选磁场的直径约为1 μm的磁性微球探针,其表面上包被有抗被检物的单克隆抗体,其标记过程主要包括磁性微球的激活和目标单抗的标记。 如何确定不同长度的DNA序列可对物种进行有小区分的范围; 对物种进行编码时,如何选择合适的基因序列; 该技术是否适合区分关系密切或快速进化的物种; 单基因物种鉴定的局限性、手持可移动DNA测序仪的设计及与条形码数据库的建立等有关的问题。 *
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