基于代谢组学与芽胞杆菌属间胞外代谢物异质性研究.docVIP

基于代谢组学的芽胞杆菌属间胞外代谢物异质性研究 陈峥，刘波*，史怀，朱育菁，刘国红，潘志针，陈梅春 (福建省农业科学院农业生物资源研究所，福建 福州 350003) 摘要：采用基于气相色谱质谱联用（GC/MS）的代谢组学方法研究了芽胞杆菌三个属胞外代谢物，得到代谢物共229种。并对结果做了PCA和分层聚类分析，结果表明供试不同属的芽胞杆代谢物种类和含量不同有所不同，而同属的菌株代谢物相似，同属的菌株能聚成一类。其中类芽胞杆菌属和芽胞杆菌属又聚为一个亚类，而短芽胞杆菌属聚为另一个亚类。通过对三个属芽胞杆菌所分析的数据中，初步鉴定得到3个差异性代谢物。 关键词：芽胞杆菌，代谢组学，属，胞外代谢物，异质性 Heterogeneity research of extracellular metabolites of three Bacillus genera based on metabonomics CHEN Zheng, LIU Bo*, SHI Huai, ZHU Yu-jing，LIU Guo-Hong， PAN Zhi-zhen，CHEN Mei-chun (Institute of Agrobiological Resources, Fujian Academy of Agricultural Sicences, Fuzhou, Fujian 350003, China) Abstract：The extracellular metabolites of three Bacillus genera were analyzed by gas chromatography/ mass spectrometry(GC/MS) based on metabonomics. 229 metabolites were indentified from these genera. The result of PCA and hierarchical cluster analysis show that the metabonomics in different generic were different. The metabonomics in the same generic were similar. The strains of the same genera could be clustered into one group. The strains of Paenibacillus and Bacillus clustered into one subgroup, and stains of Brevibacillus clustered into one subgroup. Three metabolic markers were identified from the metabolites of three Bacillus genera. Key words: Bacillus，metabonomics，genera，extracellular metabolites，heterogeneity 芽胞杆菌属Bacillus是一类产芽孢的革兰氏阳性细菌，产生具有抗逆性球形或椭圆形芽孢，芽孢对高温、紫外、干燥、电离辐射和很多有毒化学物质都有很强的抗性[1]。芽胞杆菌是一类重要的资源微生物，与人类生活关系密切，如在工业领域用于环境污染治理等、在农业领域用于生物农药等、医学领域用于新型药物载体等。 代谢组学（metabonomics）是对限定条件下特定生物样品中所有代谢组分的定性和定量[2]，是进行生物表型研究的主要手段之一，是系统生物学研究不可或缺的部分[3]。代谢组学主要的研究平台包括气相色谱质谱联用（GC/MS）、液相色谱质谱联用(LC/MS)、毛细管电泳质谱联用(CE/MS)和核磁共振(NMR)等。代谢组学在生物，农业，医学，环境等领域得到了或将会得到广泛的应用，有着非常重要的意义[4]。 芽胞杆菌的代谢物研究有过许多报道，如对芽胞杆菌挥发性物质的研究，包括枯草芽胞杆菌E20 [5]、BL02[6]、G8[6]、短短芽胞杆菌FJAT-0809-GLX[7]挥发性物质的研究等；对芽胞杆菌发酵液成分研究，包括多粘类芽胞杆菌HY96-2[8]；多粘类芽胞杆菌BS04[9]；枯草芽胞杆菌B36[10]；枯草芽胞杆菌BY-2[11]；短短芽胞杆菌FJAT-0809-GLX[12,13]等；芽胞杆菌脂肪酸成分的研究，包括需氧芽胞杆菌芽胞脂肪酸分析[14]。然而，对该短短芽胞杆菌的代谢物差异的研究未见报道，本文通过对三个芽胞杆菌属胞外代谢物异质性研究，揭示芽胞杆菌属间分类的代谢组学分析方法，分析芽胞杆菌属间差异的代谢组学基础，为