泰和乌鸡线粒体DNA遗传变异分析.pdfVIP

维普资讯 第 29卷第 5期 江 西 农 业 大 学 学 报 Vo1．29．No．5 2007年 l0月 ActaAgriculturaeUniversitatisJiangxiensis Oct．．2007 文章编号：1000—2286(2007)05—0801—04 泰和乌鸡线粒体 DNA遗传变异分析 黄族豪 ，刘遁发 ，肖宜安 ，龙 进 (1．井 冈山学院 生命科学学院，江西 吉安 343009；2．兰州大学 生命科学学院，甘肃 兰州 730000) 摘要：采用聚合链式反应(PCR)~n直接测序的方法 ，测定泰和乌鸡线粒体DNA控制区高变 I区和部分 Ⅱ区484 bp的序列 ，研究其遗传变异及其性别间的差异，并与其它 7种乌鸡的同源序列相 比较，分析它们的系统进化关 系。20个样本共发现 17个变异位点，6种单倍型。所有变异位点全部为转换 。6种单倍型中，Hap_l的比例最高， 达到40％。公鸡的单倍型数量、单倍型多样性、核苷酸多样性、核苷酸平均差异数均高于母鸡。卡平方检验显示雌 雄间遗传分化不显著。在系统发生树上 ，泰和乌鸡的单倍型比较分散，主要与余干乌鸡和雪峰乌鸡聚在一起。 关键词：泰和乌鸡；线粒体DNA控制区；遗传变异 中图分类号 ：$831．2 文献标识码 ：A GeneticVariation ofMitochondrialDNA in TaiheSilky Fowl HUANG Zu—hao，LIU Nai—fa2，XIAO Yi—an，LONG Jin (1．SchoolofLifeSciences，JinggangshanUniversity，ji’an343009，China；2。SchoolofLifeSciences， LanzhouUniversity，Lanzhou730000，China) Abstract：ThisstudyusedPCR (polymerasechainreaction)anddidexoydirectsequencingmehtodtoanalyzethe geneticvariation ofmitochondrial DNA in TaiheSilkyFowland itsdifferencebetween esxes．A totalof484 nucleotides ofhtemitochondrial DNA control-region genewere sequenced．Homologous sequencesofohterblack fowlswereused to inferhteirphylogeny．Th erewere 17variablepositions，defining six haplotypo s．Allvariationbelonged to transition．Th e mostcommon haplotypeWagHap l，which accountedofr40％．Th e haplotypo numbers，haplotypo diversity，nucleotide diversiyt nad average number of nucleotide differences of male were higher htna htoes of female． Statistically insignificna tdffierences in genetic dffierentiation were obesrved between male nad female based on test．Th e sxi haplotyposofTaihe sliky ofwlin hte phylogenetic tree did notclusterinto esparate branches，mainly clustering wiht Yugna na dXuefengblack fowls． Keywords：Taihesilkyfowl；mitoch