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- 2017-08-31 发布于安徽
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如何寻找miRNA靶基因?microRNA(miRNA)是一类能够调节基因表达的短单链內源非编码RNA(约22nt),通过与互补的mRNA选择性地结合抑制蛋白的产生,广泛存在于动物、植物、病毒等多种有机体中。miRNA通常位于基因间或者内含子区域,在细胞核内有RNA聚合酶Ⅱ转录产生具有帽子结构多聚腺苷酸尾巴的pri-miRNA。在核酸酶Drosha及其辅助因子Pasha的作用下,pri-miRNA被处理成70个核苷酸组成具有茎环结构的pre-miRNA,然后由Exportin 5等转运至细胞质。Dicer将pre-miRNA切割成约22nt的双链miRNA,双链miRNA讲解形成单链的成熟miRNA。成熟miRNA还需要与Argonaute蛋白等组装形成RNA诱导沉默复合体(RISC),RISC作用于特异mRNA的3’UTR,从而抑制翻译过程或者直接讲解mRNA。整个过程如图所示。尽管对miRNA功能的认识还不是非常清楚,但miRNA在许多生物过程中起关键作用,包括发育、细胞分化、增殖、凋亡、肿瘤转移等。准确快速地预测miRNA靶基因对于研究miRNA功能以及分析miRNA参与的生物学过程具有十分重要的意义。目前寻找miRNA靶基因的方法主要有生物信息学以及生物实验方法。1、生物信息学方法生物信息学方法主要是利用某种算法对靶基因样本进行评分及筛选。生物信息学的方法只是通过算法为研究
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