利用CODEHOP和iCODEHOP设计简并引物克隆芒果LAX基因家族片段.pdf

热带作物学报201 1，32(12)：2278-2282 篁!!竺皇!塞!竺竺竺皇!竺!!!竺垡!呈!篁竺呈! 并引物克隆芒果以X基因家族片段 李运合4．孙光明 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所．广东湛江524091 摘要详细介绍采用CODEHOP和iCODEHOP设计简并引物的方法．并利用这2个程序设计了8对简并引物， 从芒果子叶中扩增到8条不同长度的cDNA片段．测序结果表明．这些片段包含4类不同的DNA序列。经过在 NCBI上进行blastx分析，这些序列与其它植物的MX基因具有高度同源性．因此推测，芒果中的MX基因家 族其至少包括4条同源基因。研究结果表明CODEHOP和iCODEHOP设计的简并引物可信性强并具有高效性。 关键词芒果；MX基因；简并引物；iCODEHOP；克隆 。。文献标识码A 中图分类号Q78$667．7 Primers toClone以XGene of DegenerateDesign FamilyFragments CoDEHoPandiCoDEHoP MangoUsing Programs LIYunhe，SUN Guangming Abstract from of wasa to theadventitious Rooting embryos systemstudy mangocotyledonsegmentzygote good this methodof rootformation molecularmechanismwasunclear．In mechanism．However，the study，the biology CODEHOPandiCODEHOPweredetail 8 degenerateprimersdesignusing introduced，andpairsdegenerateprimes wereselectedfor differentcDNA were resultsshowedthatthese PCR．Then，8 fragmentsamplified．Sequencing thatthese contained4differentDNA Blastx on wasfound cDNAs NCBI，it fragments sequenees．Afteranalysis toone andhad withother以X areatleast gene highhomology reposed．Therefore．there belonged family genes 4 withLAXin theother re