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小麦抗叶锈基因Lr45 的一个新分子标记1
闫红飞,刘春燕,高士刚,杨文香,刘大群
河北农业大学植物病理系,河北省农作物病虫害生物防治工程技术研究中心,河北保定
(071001 )
摘 要:目的建立小麦抗叶锈基因Lr45 SCAR(sequenced characterized amplified region 序列
特征扩增区域)标记。方法 以小麦抗叶锈病基因材料TcLr45和感病材料Thatcher为亲本,利
用黑麦基因组特异的RAPD标记引物OPH20进行PCR扩增,对获得的与预期大小相同的1.5kb
的特异片段进行克隆测序,并根据该序列设计一对特异PCR 引物LRYR 和LRYF ,对
TcLr45×Thatcher F2 代单株构建的分离群体进行扩增,验证该标记与Lr45 的连锁关系,
Mapmaker 3.0软件绘制遗传连锁图。结果 该标记在TcLr45 中扩增出单一条带,片段大小为
1272 bp(命名为Ypsc20H ) ,而在感病亲本中则无扩增条带。F 代分离群体进行连锁分析,
1272 2
遗传距离为8.2 cM ,该标记为与Lr45 连锁的SCAR标记。结论 将Lr45 的RAPD标记转化成
SCAR标记。
关键词:黑麦;抗小麦叶锈基因;Lr45 ; SCAR 标记
0 引言
【研究意义】由小麦叶锈菌(Puccinia triticina )引起的小麦叶锈病是世界性的一种真菌
病害,严重发生时可造成10%~65%的产量损失[1] 。培育小麦抗叶锈品种被认为是防治小麦叶
锈病害的最为经济有效和环境安全的方法。因此,寻找与小麦抗叶锈性基因紧密连锁的稳定
的PCR分子标记是一项重要的工作,它将为抗叶锈基因的快速鉴定及品种筛选提供依据。【前
人研究进展 [2]
】黑麦属(Secale cereale) 作为小麦的第三级基因源 ,是改良小麦抗病性、品质
和产量等性状的重要外源基因供体,通过染色体工程方法结合常规育种可以将黑麦基因导入
小麦,丰富小麦的遗传变异。Flavell[3]等报道在谷类作物中黑麦重复序列的含量最高,高达
92%,其中30%为黑麦基因组特异重复序列[4] 。目前,已有用RAPD标记来鉴定小麦中的黑
麦成分的报道。Iqbal[5]等用RAPD来鉴定1RS/1BL易位系,Brunell[6]等用RAPD来鉴定2RS/2BL
2RL/2BS易位系,Gallego[7]等用RAPD来鉴定小麦-黑麦的附加系,Ko[8]等建立了黑麦特异重
复序列的RAPD标记。
小麦抗叶锈病基因Lr45发现于日木小麦与黑麦( Secale cereale) 的杂交后代中,并被定位
于2A染色体上[9],为2AS-2R#3S•2R#3L易位,其短臂为普通小麦2A染色体和黑麦2RS易位,
长臂为黑麦2RL 。到目前为止,该基因仍表现出优越的抗叶锈性,是具有应用潜力的抗叶锈
基因。 【本研究切入点】关于该基因的分子标记,张娜等分别利用AFLP[10]与SSR[11]技术获
得了该基因的分子标记,但这两个标记所获得片段具有片段小的共同缺点,均未能转化成更
为稳定、使用简便的SCAR或STS标记。本研究即利用Ko[8]等建立的黑麦特异重复序列的
RAPD标记引物对含有由黑麦向小麦转移的抗叶锈基因Lr45 的外源染色质的TcLr45材料进
行扩增,以期获得TcLr45 的RAPD标记,并将该标记转化为更为稳定的SCAR标记。 【拟解
1本课题得到基金项目:河北省自然基金项目(c2006000438 );高校博士基金(20050086002 )的资助。
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决的关键问题】建立小麦抗叶锈基因Lr45 的稳定地SCAR标记,使该标记不仅用于检测小麦-
黑麦杂合体中的异源染色质成分,而且还可以证实黑麦含有的抗叶锈基因向小麦转移的事
实。
1 材料和
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