水稻白叶枯病菌无毒新基因的克隆和序列分析.pdfVIP

第 44 卷　第 4 期 ( ) Vol. 44 No. 4 复 旦 学 报 自然科学版 2005 年 8 月 Journal of Fudan Universit y (Natural Science) Aug. 2005 　　文章编号 : (2005) 水稻白叶枯病菌无毒新基因的克隆和序列分析 1 ,2 1 1 1 2 2 1 梁　斌 ,张鑫军 ,杨　晨 ,郭　滨 ,戴陆园 ,余腾琼 ,沈大棱 ( 1. 复旦大学 生命科学学院 遗传学研究所 ,上海 　200433 ; 2. 云南省农科院农作物品种资源站 , 昆明 　650205) 摘 　要 : 从菲律宾水稻白叶枯病菌 9a 生理小种的代表菌株 PXO339 中克隆到一个新的无毒基因 ,全长 2 118 bp ,编码 705 个氨基酸 ,分子质量和等电点分别约为 74. 7 ku 和 6. 585. NCBI 网站 BLAST 表明 ,该基因属于 avrBs3 基因家族 ,命名为 arp3. 与所有 avrBs3 同源基因的Alignment 分析发现 ,arp3 的 5 ’端缺少了两个长度分别 是 144 bp 和 45 bp 的片断 ,但在水稻白叶枯病菌中 ,arp3 基因的 5 ’端的特征很普遍. 全长的 arp3 基因中间区域 是一个特异的只有 5. 5 次 102 bp 的重复区 ,是已克隆的 avrBs3 基因家族中重复次数最少的一个. C - 端有 3 个 核定位信号 NL Ss 和 1 个酸性转录激活域 AAD. 关键词 : 水稻白叶枯病菌 ; 无毒基因 ; arp3 ; AvrBs3 相似蛋白 中图分类号: Q 78 　　　　　文献标识码 : A ( ) 　　植物病原菌的无毒基因产物由 t ype - Ⅲ分泌系统 TTSS 分泌 ,直接或间接与宿主相应抗病基因产物 相互作用 ,激发宿主的抗病反应. 目前已有40 个 avr 基因被克隆 1 ,除了 avrRxv/ yopJ 和 avrBs3 两个基因 2 ( 家族 ,大多数无毒基因之间很少甚至不相同 . avrBs3 基因家族所有成员均来自黄单胞菌属 Xan thomonas) ,avrBs3 基因是从 X . campest ris pv . vesivatoria 中克隆到的该家族的第一个成员3 . AvrBs3 相 似蛋白高度保守 ,氨基酸序列相似性达 90 %～97 %4 ,这些蛋白的一个典型结构特征是它们的中心区域 ( 由34 个氨基酸为一重复单元构成数目不定的重复区 ,C - 端具有三个核定位信号 Nuclear Localization ) ( ) Signals ,NL Ss 和一个酸性转录活性域 Acid Transcriptional Activation Domain ,AAD . 水稻白叶枯病菌株 PXO339 是菲律