澄黄滨珊瑚ferritin基因部分cDNA序列的获得及分析.pdfVIP

2013 年 第 58 卷 第 17 期： 1590 ~ 1595 《中国科学》杂志社 专题: 南海珊瑚生物学与珊瑚礁生态学 论 文 SCIENCE CHINA PRESS 澄黄滨珊瑚ferritin 基因部分cDNA 序列的获得及分析 ①②③ ①②* ①② ①② ①② ①② 许昌有 , 黄晖 , 练健生 , 尤丰 , 袁涛 , 周国伟 ① 中国科学院南海海洋研究所海洋生物资源可持续利用重点实验室, 广州 510301; ② 中国科学院海南海海洋研究所南热带海洋生物实验站, 三亚 572000; ③ 中国科学院研究生院, 北京 100049 * 联系人, E-mail: huanghui@ 2012-02-09 收稿, 2012-06-04 接受, 2012-08-02 网络版发表 摘要 造礁石珊瑚为珊瑚礁生态系统中的框架生物, 研究其重要功能基因对于理解造礁石珊 关键词 瑚对环境变化的响应有重要指示意义. 本研究提取了澄黄滨珊瑚(Porites lutea) 的总RNA, 通过 造礁石珊瑚 RT-RCR 得到cDNA, 并以cDNA 为模板设计引物进行test PCR, 获得大小为254 bp 的ferritin RNA cDNA 基因cDNA 序列. 分析表明, 该部分序列编码了84 个氨基酸, 其中包含一个亚铁氧化酶活性功 PCR 能区, 而该活性功能区又有一个铁离子通道, 其与多孔鹿角珊瑚(Acropora millepora ) 的ferritin ferritin 基因相似度较高, 达 85%, 覆盖度为 100%, 推测该基因序列在种内和种间都较保守, 已向 GenBank 提交序列, 并获得登录号为 JQ305796. 该序列可用于实时定量 PCR 技术(qRT-PCR) 及cDNA 末端快速扩增技术(RACE)等后续分子生物学研究. 珊瑚礁生态系统具有极高的生物多样性, 且对 物[10,11], 而L 亚基则协助铁进入中央腔以及支持铁蛋 环境变化的响应极其灵敏[1], 其主要框架生物造礁石 白复合物结构的稳定. 铁蛋白高度保守的结构、生化 珊瑚属于刺胞动物门. 近年来, 随着基因组学和蛋白 特性和分布的广泛性突出了它在生物体中的重要性, 质组学在造礁石珊瑚研究中的应用, 越来越多的学 然而, 珊瑚ferritin 基因的相关研究较少, Schwarz 等 者开始从基因的角度来研究造礁石珊瑚[2,3]. 对海葵 人[12] 的研究比较了鹿角珊瑚 Acropora palmata 和深 及珊瑚的研究表明, 刺胞动物与脊椎动物间有大量 水石珊瑚 Montastraea faveolata 的 H 型铁蛋白(H 相同或相似的基因, 珊瑚的复杂基因组结构及功能 ferritin)在发育各个时期的表达情况, 发现其在发育 [4] 加深了对刺胞动物的理解 . 过程中的表达量很大. 先前的研究表明, 铁蛋白H 亚 在生物有机体中, 铁是参与细胞代谢所必需的 基的氨基酸序列高度保守, 它们的相似性介于 88%~ 微量元素之一. 铁蛋白(ferritin)是广泛存在于动物、 99%,