微孔隙中流体扩散系数分子动力学模拟并行算法的研究.pdfVIP

第 卷 第 期 计 算机 与 应 用 化 母 , 年 月 日 叮 , 微孔 隙 中流体扩散 系数分子 动 力 学模拟 的并行算法研 究 , , , ’ ’ ’ ’ 秦 星 张秉 坚 吕巧 明 胡文 暄 浙 江 大 学 化学 系 , 浙 江 , 杭 州 , 南京 大学地球 科学 系 , 江 苏 , 南京 , 摘 要 扩 散系数 计算量 非 常大 , 为提 高计算效率研 究采 用 并行计算 替代单机 计 算 用 非 阻塞 通 信 替代 阻塞 通 信 利用 元胞 分解 的 要 贝 子列 用 贝 子 和 动 子 的重 通 , 空 间 上 成 果创 建 拷 的外层 粒 表 拷 粒 移 粒 叠 部分来 减 少 信量 在 分解 算 法 的基 础 对 模拟 的并行算法进 行 了改进 , 使并行计算 的效率提 高 了 。 用 改进 的 并行 计算方法 , 以 位操作 系 统 和 基 于 消息传递 界 面 的 四节 点计 算机 集 群 系统 。 对 水 分 子在 宏 量 条件 下 以及 限于 硅 酸 狭