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282 包 芸等:一种新的高效并行算法
一种新的高效并行算法
包 芸
中山大学应用力学与工程系,510275
廖新浩 李力刚
中国科学院国家天文台,200030
摘 要 一种构造求解 3D 偏微分方程的高效并行计算算法的新思路。从差分格式上寻找切缝
分块进行无信息交换的并行差分计算,而后在处理器间同时进行切面上的信息交换。基于此思
想构造的半隐式切瓜并行算法,对天体力学地球坐标系中的单一热扩散方程行试验计算,实际
并行效率高达 95% 以上。
关键词 并行计算;数值模拟;天体力学
中图分类号 P14
随着科学发展到二十一世纪的今天,大型科学数值模拟计算在海洋、天文、环境等多个
领域中占有越来越重要的分量和位置。计算机的飞速发展也为解决这些领域中描述各种问题
的非线性、非定常偏微分方程组的数值求解提供了很好的硬件工具,使得各种大尺度、长周
期的复杂问题有了数值求解的可能。然而超快速运算的计算都是以并行计算来提高速度的。
如何进行并行计算,寻找高效的并行算法,成为了阻碍大尺度、长周期复杂问题数值计算发
展和应用的“瓶颈”,也是目前发展高性能计算方法的一个重要课题。以往的并行算法大都是
由计算力学的专家们选好差分格式、计算模式后,由专门的并行专家对已有计算方法进行并
行化处理,并行效率往往不尽人意[1~3] 。我们不妨换一个角度去考虑并行计算问题。由计算力
学专家在考虑差分格式、计算模式的同时就把并行计算作为一个目标,构造出几乎完全并行
的算法。基于这种思路,我们在研究地球外核流体力学的长周期数值模拟计算中,构造出地
球坐标系中的半隐式切瓜并行算法,并以单一热扩散方程数值求解对其并行效率进行验证。
1 基本方程
地球外核动力学研究区域为一有内核存在的球壳体 (如图1)。其中内半径为r ,外半径r
i 0
且:
包 芸等:一种新的高效并行算法 283
η 1
r , r
i 0
1−η 1−η
η 为一参数,本文中η =0.4 。
r
rii
r0 取球体坐标系(r,θ ,φ ),r 为半径方向,θ 为北极到极半径与极轴的
r o
夹角,φ 为绕极轴的夹角。
地球外核热对流问题是由一组较复杂的偏微分方程组[4]来描述的。
图 1 研究区域 为了检验半隐式切瓜并行算法的并行效率,我们选取地球坐标系中较
简单的单一热扩散方程为计算算例。
设扩散方程为
∂H 2
=∇ +
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