软体动物线粒体DNA研究和应用.pdfVIP

软体动物线粒体DNA 的研究和应用 1 2 2 2 2 许逸天 ，吴常文 ，吕振明 ，常抗美 ，张建设 1 宁波大学生命科学与生命技术学院，浙江宁波（315211 ） 2 浙江海洋学院、海洋科学学院，浙江舟山（316004) E-mail ：2845417@163.com 摘 要：线粒体DNA 作为一种有效的分子标记已经越来越多的用在软体动物遗传学的分析 上。并取得了许多成果。本文阐述了软体动物线粒体DNA 的研究进展,主要介绍了软体动物 线粒体DNA 序列的研究概况和线粒体DNA 的多态性在软体动物的系统发生、起源进化、 地理分化和群体识别上的应用情况。 关键词：软体动物，线粒体DNA ，遗传差异，系统发生 1. 引言 自从线粒体DNA （mtDNA ）被Nass 等（1962）发现。在mtDNA 的机构、组成、转录、 翻译、调控等方面,国内外积累了大量的资料。mtDNA 作为核外遗传物质,与核对DNA 相比, [1] 具有分子小、结构简单、进化速度快、母性遗传（桂建芳,1990 ） 、无组织特异性等特点, 是一个相对独立的复制单位。由于mtDNA 的特殊结构特征和遗传特征以及它在生命活动中 的特殊重要作用, 已经成为热门的研究对象之一,特别是它作为一种有效的分子遗传标记,在 软体动物的起源进化,亲缘关系, 群体遗传结构等方面都具有十分重要的意义。 [2] 软体动物（Mollusca ）是动物界中的第二大门 。是许许多多动物的一个综合名词,种类 繁多,生活范围极广,海水、淡水和陆地均有产。已记载130000 多种,仅次于节肢动物。包括 双神经纲（如石鳖) 、腹足纲（如鲍、蜗牛) ；掘足纲（如角贝)、瓣鳃纲(如蚶、牡蛎) 、头足 纲（如乌贼、鹦鹉螺)等,其中有许多具有较高的研究价值和经济价值。如鹦鹉螺是现存软体 动物中最古老的一种,作为活化石为人们研究头足类进化演变提供许多参考依据。又如鲍鱼, 乌贼作为食物,石决明,海螵蛸作为药物,另外还有具有观赏价值和工、农业价值的一些种类。 都为我们带来大量的经济价值。 2. 软体动物线粒体DNA 组成和全序列 [3] 动物线粒体基因组含有22 种tRNA 基因 ,大小2 种rRNA 基因(12SrRNA、16SrRNA) 和13 种蛋白编码基因(PCG),后者包括了与线粒体内膜相结合的酶复合体的亚单位:细胞色素 b(Cytb),2 个ATP 酶的亚单位(ATPase6,ATPase8),3 个细胞色素C(Cytc)氧化酶的亚单位 (CO Ⅰ,CO Ⅱ,COⅢ),7 个NADH 还原酶复合体的亚单位(ND1,2,3,4,4L,5,6);基因组中还有1 个 非编码区,在脊椎动物中称D-loop,在无脊椎动物中称AT2 丰富区(AT2richregion)或控制区 (putativecontrolregion) 。至今为止,大量的动物线粒体DNA 序列测定的结果表明,大多动物的 线粒体基因组全序列长度一般在15kb-20kb 之间,软体动物的线粒体全基因组大小一般在 [4] [5] 16kb 左右,而其中个别的种类的线粒体基因组长度可达32kb （大西洋扇贝）,Junji Sasuga 等人在对Loligo bleekeri 的部分线粒体基因序列的研究结果表明，其基因组构成与大多软体 动物有类同之处，ND4,ND5 的碱基排列呈现出典型的四叶草结构，并且认为这样的结构起 源于组氨酸的tRNA 。Genebank 中各个物种的线粒体基因组序列在近20 年来急剧增加,有关 软体动物的核苷酸序列在genebank 中找到547983 个。关键词