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食品生物技术实验指导
何志平 等编
农业与食品科学学院
20012.10
实验一 质粒DNA的提取及电泳检测
一 实验目的
通过本实验学习掌握碱裂解法提取细菌质粒DNA。
二 实验原理
1. 细菌中有两种DNA,即染色体DNA和质粒DNA。
2. 质粒DNA的提取方法有三种:碱裂解法,煮沸法,去污剂(如Triton和SDS)裂解法。3. 碱裂解法比较剧烈,可破坏碱基配对,使宿主细胞DNA变性,共价闭合环状DNA由 于空间缠绕,两条链不会彻底分开。当外界条件到达复性条件时,质粒DNA的双链又迅速恢复原状,而较大的线性染色体DNA难以复性。
三 实验材料:转化后的细菌(含有质粒的大肠杆菌)
四、实验用具和药品
1. 实验用具:
摇床,离心机,移液器及枪头,玻璃试管(15mL)及塞子,离心管(1.5mL)
2. 实验试剂:
1 溶液I
50 mmol/L 葡萄糖
25 mmol/L 三羟甲基氨基甲烷(Tris)Tris·HCl(pH8.0)
10 mmol/L 乙二胺四乙酸(EDTA)(pH8.0)
2 溶液II
0.4mol/L NaOH,2%SDS,用前等体积混合
3 溶液III 5 mol/L 乙酸钾 60ml
冰乙酸 11.5ml
水 28.5ml
4 TE 缓冲液
10 mmol/L Tris·HCl(pH8.0)
1 mmol/L EDTA(pH8.0)
5 70%乙醇(放-20℃冰箱中,用后即放回)
6 RNA酶
将RNA酶溶于10 mmol/L Tris·HCl(pH7.5)、15 mmol/LNaCl中,配成10mg/ml的浓度,于100℃加热15min,缓慢冷却至室温,保存于-20℃。
7 加样缓冲液(6X):40%蔗糖、0.25%溴酚兰
电泳缓冲液:0.045mol/L Tris-硼酸? ?0.001mol/L EDTA (0.5X TBE buffer)
贮存液:
5X:54g Tris碱? ? 27.5g硼酸? ? 20ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)
五 实验步骤
(一)细菌繁殖
挑取白色的单菌落若干,转移到3mL液体LB培养基(附加100mg/ml Amp ),37℃过夜振荡(200r/min)培养。
(二)菌体收集
将过夜培养的菌体转入1.5mL离心管,离心30sec 5000r/min;弃上清提取质粒
(三)质粒提取
方法一:碱裂解法提取质粒DNA
1..将上述沉淀重悬于μL冰预冷的溶液Ⅰ中,剧烈震荡;
2.加入μL溶液Ⅱ,盖紧管口,快速颠倒离心管5~10次;
3.加入μL冰预冷的溶液Ⅲ,盖紧管口,温和地颠倒离心管5~10次;9000r/min离心5min上清转移到另一新1.5mL离心管中;
4.加等体积氯仿,振荡混合,静置, 9000r/min离心5min,上清转移到另一新1.5mL离心管中;
5.加入1/10体积3mol/L的醋酸钠和2倍体积的乙醇,充分混匀,静置5min;9000r/min离心5min;
6.弃上清,用70%ethanol洗涤;
7.加30μLTE溶解,-20 ℃保存。
方法二:试剂盒提取方法
1.离心收集的菌体中加入含RNAase的溶液Ⅰ250μL,重悬菌体;
2. 加溶液Ⅱ250μL,轻轻颠倒离心管~10次,静止(1-2分钟),至溶液澄清;
3. 加入350μL冰预冷的溶液Ⅲ,快速颠,20-30次;
4. 12000r/min离心10min;
5. 将上清转移到DNA结合离心管中,12000r/min离心1min;
6. 加入去蛋白试剂500μL,12000r/min离心1min;
7. 加洗涤液750μL,12000r/min离心1min;
8. 加洗涤液700μL,12000r/min离心1min;
9. DNA结合柱12000r/min离心2min,去除残余的洗涤液;
10 DNA结合柱放入另一个新的1.5mL离心管中,室温1-2min,加入洗脱缓冲液50-100μL;
11 12000r/min离心1min;
(四)检测提取DNA质量的电泳检测。
取2ul质粒DNA+2ul加样缓冲液+6ul ddH2O;
配制1%的琼脂糖凝胶
电泳30min,EB染色,拍照。
注意事项:氯仿对眼睛、皮肤、粘膜及呼吸道都有刺激作用,它是致癌剂并可损伤肝脏和肾脏,操作时需戴手套、口罩。
六 实验作业
1. 思考本实验的关键步骤是什么?
2. 琼脂糖电泳鉴定质粒DNA时,能看到几条带,快慢顺序是什么?
3. 附上电泳图片
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