应用Spoligo+typing技术对吉林省结核分枝杆菌基因分型的研究.pdfVIP

应用Spoligotyping技术对吉林省结核分枝杆菌 基因分型的研究 杨修军1万康林2 王艳华1 赵秀琴2 郭建华1 张媛媛2 王春生1 1.吉林省疾病预防控制中心，吉林长春 130062 2.中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 [摘要]目的 使用间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)对吉林省333株结核分枝杆菌临床分离株进行基 因分型。方法 收集吉林省内结核分枝杆菌临床分离株，应用Spoligotyping方法进行基因分型研究。基因聚类分 析采用BioNumerics软件。结果 共在吉林省内收集到333株结核分枝杆菌临床分离株，可分为2个基因群，即北 京家族(Beijingfamily)或称北京基因型(Beijinggenotype)，非北京家族(non-Beijingfamily)，分别占89.5％(298/ 333)和10.5％ (35/333)，29种基因型。其中22株为独特类型，余311株分为7簇。北京家族菌株中，95.0％ (283/298)为典型北京家族，非北京家族菌株表现为高度的基因多态性，可分为19个基因型，16株为独特的基因 型。结论 吉林省结核分枝杆菌存在明显的基因多态性。 [关键词]结核分枝杆菌;间隔区寡核苷酸分型；基因分型；北京基因型 R378.91 A Genotypingin333StrainsofMycobacteriumTuberculosisIsolatedfromJilinProvivcebySpoligotypingTechnology YANGXiu-junWANKang-linWANG Yan-hua JilinProvincialCenterforDiseaseControlandPrevention, ChangchunJilin130062,China [Abstract]Objective TostudythegenotypicdistributionofmycobacteriumtuberculosisinJilinprovincebyspligo typing.MethodsMycobacteriumtubercubsisisolatedfromJilinprovinceweregenotypedbyspoligotypingandBioNumer ic.Results 333strainsofmycobacteriumtubercubsiscouldbedividedinto2families,whichwereBeijingfamilyandnon -Beijingfamily,occupying89.5％ (298/333)and10.5％ (35/333),respectively,therewere29kindsofgenotypes.22 genotypeswereunique,therestbebngedto7genotypes.95.0％ (283/298)ofBeijingfamilywastypicalBeijingfamily, thestrainsbelongingtonon-Beijingfanilymarkedgenepolynorphism.whichaccountedfor19genotypes,inwhich16gen otypeswereunique.Conclusion TherearegenepolymorphisminmycobacteriumtubercubsisfromJilinprovince. [Keywords] Mycobacteriumtubercubsis;Spoligotyping;Genotype;Beijinggenotype 所，作为本次试验的对照菌株。 衷1 43个寡核苷酸探针1)NA序歹!『 1．2 DNA提取用生理盐水从L．J培养基的斜序号81 基因间隔子数目 寡核苷酸探针序列 面上洗脱菌体，80珊育30min灭活’离心收集菌 I 2 000 2 3 体，用400肚lTE悬菌，于沸水中煮沸30min，12