双列资料的遗传模型分析.docVIP

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双列资料的遗传模型分析 莫惠栋 The Analysis of Genetical Model for Diallel Data 一、基本原理 设某性状仅受一对等位基因控制,和分别为增效和减效等位基因,且各具频率和。当将纯系和作为亲本系,进行双列杂交时,其亲本和子一代的基因型和型值可列于表1。 表1一对等位基因时双列杂交的基因型和型值 ♂ ♀ 均值平均 型值平均: 由表1可得到以和为公共亲本的系列(array)的平均数和分别为: (1) 总平均数为: (2) 以和为公共亲本的系列的方差则为: (3) 各系列的平均方差则为: (4) 同理可得和为公共亲本时,非公共亲本与后裔的协方差(这实际上是半同胞的亲子协方差)分别为: (5) 而各系列的平均协方差则为: (6) 根据上述结果,即可作出以下分析: (一)线性回归分析 由(3)和(5)可知,系列间方差和协方差的差量和分别为: 因此,若以为横坐标,为纵坐标,则点和点连成直线的斜率为: (7) 该直线必通过点,且具截距: (8) 上述结果的几何图像见图1。这一结果对于具有对独立基因的多基因系统仍然适用。因此,在处理实际资料时,可用为的变数,为的变数,进行线性回归分析。若:被否定,而:被接受,即可推断基因作用的方式是属于加性-显性模型的。而的估计值则表示着显性的类别:接受为部分显性,接受为完全显性,接受为超显性。 (二)方差分析 如果在上述回归分析中接受或否定,则性状的遗传并不符合加性-显性模型。这时,有两种可能:(1)不存在显性效应。因为由(3)和(5)可知,当时,,它们聚集在一点,不能形成线性回归关系。(2)上位性效应的干扰。一般地说,在接受时,这两种可能都不能排除;在否定又否定时,主要的可能是还存在上位效应。这些可能性,应用各公共亲本的和的和或差的方差分析,可以作出检查。 对表1各公共亲本的和求和可得: (9) 若不存在显性效应,两者显然是同质的, 即;若,则不同质。因此,测验各公共亲本间的差异显著性,也就测验了。 对表1各公共亲本的和求差可得: (10) (10)表明,若只有加性和显性效应,各公共亲本的同质;若还有上位效应,则不同质。因此,测验各公共亲本间的差异显著性,就可推断上位性效应是否存在。以上结果对具有对彼此独立的等位基因的多基因系统同样适用。 上述分析的具体做法是:按重复列出个或的值,以之作为新变量,用单项分组资料的方差分析法(因为区组间变异亦属环境误差)作出测验。 (三) 显、隐性基因在亲本系中的分布和作用的分析 在加性-显性遗传模型为适合时,可先假定(即对取绝对值),以确定各亲本所包含显,隐性基因数的相对多少;然后在分析显(隐性)基因的作用方向是正向(增效)或负向(减效)。在表1和图1可知,一定有。因此,在依的回归图中位于左下方,位于右上方。这个结论对多基因系统亦适用,即包含显性基因愈多的亲本,其和愈小,而含隐性基因愈多的亲本则和愈大。所以,根据公共亲本在依的回归图上的大小次序,可推断其所包含显(隐)性等位基因频率的相对高低。 又由于和为公共亲本的亲子协方差和子代方差,因此再求出亲代方差,即可得到半同胞亲子相关系数: (11) 当不存在环境误差时,(11)的;若有环境误差,则。若令之为1,即可得到: (12) (12)是一抛物线方程,它是和关系的另一种关系表达式。由于它是令导出,而实际试验总是含有环境误差的,所以依的回归直线和点必位于该抛物线的内侧[因此又称(12)为限制抛物线(limiting parabora)];而该抛物线与回归直线在右上方和左下方的两个相交点,则分别表示了隐性和显性基因联合态亲本的可能位置。上述分别可参见图2。 有了上述结果,就可方便地推论显(隐)性基因的作用方向。因为和分别表示了显性基因数最多(隐性基因最少)和隐性基因数最多(显性基因最少)亲本,所以计算和亲本表现型值的相关系数就可以作出相应推断;若为正相关,表示增效基因为隐性基因;若为负相关,表示显性基因为增效基因; (四)遗传模型的参数估计 在加性-显性模型为适合时,模型参数和可从多个方面估计。例如系列平均数的方差和协方差和,亲本互作方差等,皆含有一定的和分量*,可应用最小平方法作出和的综合估计。但适合本分析系统而又较为简便的一个方法,是仅从具有较大信息量的和估计。 这里应注意到:实际试验而得到,等都是含有环境误差的。前面的三项分析,由于属“定性”性质或相对考虑,可不必顾及。但在估计模型参数时,为保证无效

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